Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NefhP19246 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NefhP19246 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NefhP19246 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NefhP19246 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NefhP19246 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NefhP19246 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NefhP19246 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NefhP19246 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NefhP19246 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NefhP19246 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NefhP19246 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NefhP19246 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NefhP19246 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NefhP19246 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NefhP19246 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NefhP19246 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NefhP19246 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NefhP19246 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NefhP19246 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NefhP19246 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NefhP19246 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NefhP19246 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NefhP19246 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NefhP19246 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NefhP19246 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NefhP19246 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NefhP19246 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NefhP19246 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NefhP19246 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NefhP19246 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NefhP19246 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NefhP19246 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NefhP19246 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NefhP19246 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NefhP19246 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NefhP19246 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NefhP19246 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NefhP19246 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NefhP19246 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NefhP19246 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NefhP19246 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NefhP19246 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NefhP19246 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NefhP19246 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NefhP19246 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NefhP19246 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NefhP19246 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NefhP19246 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NefhP19246 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NefhP19246 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NefhP19246 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NefhP19246 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NefhP19246 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NefhP19246 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NefhP19246 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NefhP19246 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NefhP19246 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NefhP19246 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NefhP19246 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NefhP19246 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NefhP19246 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NefhP19246 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NefhP19246 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NefhP19246 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NefhP19246 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NefhP19246 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NefhP19246 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NefhP19246 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NefhP19246 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NefhP19246 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NefhP19246 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NefhP19246 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NefhP19246 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NefhP19246 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NefhP19246 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NefhP19246 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NefhP19246 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NefhP19246 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NefhP19246 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NefhP19246 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NefhP19246 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NefhP19246 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NefhP19246 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NefhP19246 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NefhP19246 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NefhP19246 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NefhP19246 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NefhP19246 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NefhP19246 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NefhP19246 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NefhP19246 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NefhP19246 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NefhP19246 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NefhP19246 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NefhP19246 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NefhP19246 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NefhP19246 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NefhP19246 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NefhP19246 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms