Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Vpreb1P13372 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Vpreb1P13372 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Vpreb1P13372 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Vpreb1P13372 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC14□□□□□ -0.17
Vpreb1P13372 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Vpreb1P13372 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Vpreb1P13372 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Vpreb1P13372 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Vpreb1P13372 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Vpreb1P13372 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Vpreb1P13372 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Vpreb1P13372 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Vpreb1P13372 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Vpreb1P13372 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Vpreb1P13372 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Vpreb1P13372 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Vpreb1P13372 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Vpreb1P13372 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Vpreb1P13372 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vpreb1P13372 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vpreb1P13372 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vpreb1P13372 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vpreb1P13372 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vpreb1P13372 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vpreb1P13372 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vpreb1P13372 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vpreb1P13372 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vpreb1P13372 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vpreb1P13372 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vpreb1P13372 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vpreb1P13372 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vpreb1P13372 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vpreb1P13372 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vpreb1P13372 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vpreb1P13372 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vpreb1P13372 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vpreb1P13372 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vpreb1P13372 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vpreb1P13372 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vpreb1P13372 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vpreb1P13372 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vpreb1P13372 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vpreb1P13372 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vpreb1P13372 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vpreb1P13372 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vpreb1P13372 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vpreb1P13372 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vpreb1P13372 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vpreb1P13372 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vpreb1P13372 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vpreb1P13372 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vpreb1P13372 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vpreb1P13372 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vpreb1P13372 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Vpreb1P13372 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Vpreb1P13372 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Vpreb1P13372 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Vpreb1P13372 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vpreb1P13372 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vpreb1P13372 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vpreb1P13372 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vpreb1P13372 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vpreb1P13372 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vpreb1P13372 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vpreb1P13372 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vpreb1P13372 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vpreb1P13372 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vpreb1P13372 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Vpreb1P13372 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vpreb1P13372 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vpreb1P13372 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vpreb1P13372 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vpreb1P13372 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vpreb1P13372 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vpreb1P13372 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vpreb1P13372 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vpreb1P13372 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vpreb1P13372 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vpreb1P13372 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vpreb1P13372 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vpreb1P13372 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vpreb1P13372 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vpreb1P13372 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vpreb1P13372 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vpreb1P13372 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vpreb1P13372 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vpreb1P13372 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vpreb1P13372 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vpreb1P13372 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vpreb1P13372 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vpreb1P13372 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vpreb1P13372 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vpreb1P13372 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vpreb1P13372 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vpreb1P13372 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vpreb1P13372 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vpreb1P13372 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vpreb1P13372 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vpreb1P13372 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms