Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chrm1P12657 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chrm1P12657 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chrm1P12657 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chrm1P12657 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chrm1P12657 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chrm1P12657 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chrm1P12657 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chrm1P12657 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chrm1P12657 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Chrm1P12657 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chrm1P12657 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chrm1P12657 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chrm1P12657 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chrm1P12657 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chrm1P12657 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chrm1P12657 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chrm1P12657 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chrm1P12657 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chrm1P12657 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chrm1P12657 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chrm1P12657 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Chrm1P12657 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chrm1P12657 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chrm1P12657 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Chrm1P12657 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chrm1P12657 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chrm1P12657 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chrm1P12657 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Chrm1P12657 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chrm1P12657 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chrm1P12657 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chrm1P12657 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Chrm1P12657 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chrm1P12657 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chrm1P12657 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chrm1P12657 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chrm1P12657 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Chrm1P12657 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chrm1P12657 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chrm1P12657 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Chrm1P12657 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chrm1P12657 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chrm1P12657 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chrm1P12657 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chrm1P12657 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chrm1P12657 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chrm1P12657 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chrm1P12657 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chrm1P12657 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chrm1P12657 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chrm1P12657 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chrm1P12657 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chrm1P12657 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chrm1P12657 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chrm1P12657 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chrm1P12657 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chrm1P12657 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Chrm1P12657 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chrm1P12657 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chrm1P12657 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chrm1P12657 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chrm1P12657 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chrm1P12657 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chrm1P12657 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chrm1P12657 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chrm1P12657 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chrm1P12657 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chrm1P12657 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chrm1P12657 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chrm1P12657 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chrm1P12657 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chrm1P12657 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chrm1P12657 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chrm1P12657 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chrm1P12657 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chrm1P12657 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chrm1P12657 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chrm1P12657 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chrm1P12657 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chrm1P12657 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chrm1P12657 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chrm1P12657 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chrm1P12657 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chrm1P12657 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chrm1P12657 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chrm1P12657 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Chrm1P12657 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chrm1P12657 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chrm1P12657 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chrm1P12657 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chrm1P12657 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chrm1P12657 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chrm1P12657 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Chrm1P12657 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chrm1P12657 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chrm1P12657 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chrm1P12657 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chrm1P12657 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chrm1P12657 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.6 ms