Protein–RNA interactions for Protein: P01811

Ig heavy chain V region UPC10, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01811 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01811 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01811 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01811 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01811 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01811 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01811 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01811 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01811 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01811 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01811 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01811 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01811 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01811 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01811 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01811 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01811 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
P01811 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01811 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01811 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01811 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01811 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01811 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01811 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01811 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01811 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01811 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01811 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01811 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01811 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01811 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01811 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01811 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01811 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01811 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01811 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01811 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01811 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01811 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01811 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01811 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01811 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01811 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01811 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01811 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01811 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01811 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01811 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01811 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01811 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01811 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01811 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01811 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01811 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01811 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01811 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01811 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P01811 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01811 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01811 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01811 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01811 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01811 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01811 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01811 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01811 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01811 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01811 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01811 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01811 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01811 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01811 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01811 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01811 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01811 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
P01811 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
P01811 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01811 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01811 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
P01811 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
P01811 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01811 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01811 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01811 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01811 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01811 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01811 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01811 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01811 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01811 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01811 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01811 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01811 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
P01811 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01811 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01811 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01811 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01811 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01811 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01811 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.6 ms