Protein–RNA interactions for Protein: P01678

Ig kappa chain V-VI region SAPC 10, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01678 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
P01678 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
P01678 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
P01678 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
P01678 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
P01678 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P01678 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P01678 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
P01678 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P01678 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
P01678 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P01678 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P01678 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P01678 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P01678 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P01678 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
P01678 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
P01678 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
P01678 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
P01678 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
P01678 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
P01678 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
P01678 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
P01678 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
P01678 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
P01678 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
P01678 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
P01678 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
P01678 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
P01678 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
P01678 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
P01678 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
P01678 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
P01678 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
P01678 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
P01678 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
P01678 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
P01678 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
P01678 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
P01678 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
P01678 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
P01678 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
P01678 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
P01678 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
P01678 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
P01678 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
P01678 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
P01678 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
P01678 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
P01678 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
P01678 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
P01678 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
P01678 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
P01678 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
P01678 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
P01678 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
P01678 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
P01678 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
P01678 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
P01678 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
P01678 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
P01678 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
P01678 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
P01678 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
P01678 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
P01678 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
P01678 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
P01678 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
P01678 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
P01678 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
P01678 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
P01678 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
P01678 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
P01678 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
P01678 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
P01678 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
P01678 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
P01678 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
P01678 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
P01678 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
P01678 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
P01678 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
P01678 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
P01678 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
P01678 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
P01678 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
P01678 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
P01678 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
P01678 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
P01678 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
P01678 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
P01678 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
P01678 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
P01678 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
P01678 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
P01678 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
P01678 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
P01678 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
P01678 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
P01678 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms