Protein–RNA interactions for Protein: P00520

Abl1, Tyrosine-protein kinase ABL1, mousemouse

Predictions only

Length 1,123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abl1P00520 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Abl1P00520 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Abl1P00520 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Abl1P00520 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Abl1P00520 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Abl1P00520 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Abl1P00520 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Abl1P00520 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Abl1P00520 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Abl1P00520 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Abl1P00520 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Abl1P00520 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Abl1P00520 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Abl1P00520 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Abl1P00520 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Abl1P00520 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Abl1P00520 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Abl1P00520 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Abl1P00520 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Abl1P00520 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Abl1P00520 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Abl1P00520 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Abl1P00520 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Abl1P00520 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Abl1P00520 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Abl1P00520 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Abl1P00520 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Abl1P00520 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Abl1P00520 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Abl1P00520 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Abl1P00520 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Abl1P00520 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Abl1P00520 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Abl1P00520 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Abl1P00520 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Abl1P00520 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Abl1P00520 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Abl1P00520 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Abl1P00520 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Abl1P00520 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Abl1P00520 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Abl1P00520 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Abl1P00520 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Abl1P00520 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Abl1P00520 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Abl1P00520 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Abl1P00520 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Abl1P00520 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Abl1P00520 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Abl1P00520 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Abl1P00520 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Abl1P00520 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Abl1P00520 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Abl1P00520 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Abl1P00520 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Abl1P00520 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Abl1P00520 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Abl1P00520 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Abl1P00520 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Abl1P00520 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Abl1P00520 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Abl1P00520 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Abl1P00520 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Abl1P00520 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Abl1P00520 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Abl1P00520 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Abl1P00520 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Abl1P00520 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Abl1P00520 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Abl1P00520 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Abl1P00520 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Abl1P00520 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Abl1P00520 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Abl1P00520 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Abl1P00520 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.76■■□□□ 1.72
Abl1P00520 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Abl1P00520 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Abl1P00520 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Abl1P00520 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Abl1P00520 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Abl1P00520 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Abl1P00520 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Abl1P00520 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Abl1P00520 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Abl1P00520 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Abl1P00520 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Abl1P00520 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Abl1P00520 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Abl1P00520 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Abl1P00520 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Abl1P00520 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Abl1P00520 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Abl1P00520 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Abl1P00520 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Abl1P00520 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Abl1P00520 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Abl1P00520 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Abl1P00520 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Abl1P00520 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Abl1P00520 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms