Protein–RNA interactions for Protein: O88632

Sema3f, Semaphorin-3F, mousemouse

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3fO88632 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sema3fO88632 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sema3fO88632 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sema3fO88632 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sema3fO88632 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sema3fO88632 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sema3fO88632 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sema3fO88632 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sema3fO88632 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sema3fO88632 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sema3fO88632 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sema3fO88632 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sema3fO88632 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sema3fO88632 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sema3fO88632 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sema3fO88632 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sema3fO88632 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sema3fO88632 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Sema3fO88632 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sema3fO88632 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sema3fO88632 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sema3fO88632 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Sema3fO88632 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Sema3fO88632 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sema3fO88632 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Sema3fO88632 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sema3fO88632 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sema3fO88632 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sema3fO88632 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sema3fO88632 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sema3fO88632 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sema3fO88632 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sema3fO88632 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sema3fO88632 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sema3fO88632 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sema3fO88632 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sema3fO88632 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sema3fO88632 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sema3fO88632 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sema3fO88632 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sema3fO88632 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Sema3fO88632 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sema3fO88632 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sema3fO88632 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sema3fO88632 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sema3fO88632 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sema3fO88632 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sema3fO88632 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sema3fO88632 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sema3fO88632 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sema3fO88632 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sema3fO88632 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sema3fO88632 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sema3fO88632 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sema3fO88632 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sema3fO88632 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sema3fO88632 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sema3fO88632 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sema3fO88632 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sema3fO88632 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sema3fO88632 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sema3fO88632 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sema3fO88632 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sema3fO88632 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sema3fO88632 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sema3fO88632 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sema3fO88632 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sema3fO88632 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sema3fO88632 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sema3fO88632 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sema3fO88632 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sema3fO88632 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sema3fO88632 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sema3fO88632 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sema3fO88632 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sema3fO88632 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sema3fO88632 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sema3fO88632 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Sema3fO88632 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sema3fO88632 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sema3fO88632 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Sema3fO88632 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sema3fO88632 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sema3fO88632 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Sema3fO88632 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Sema3fO88632 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Sema3fO88632 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Sema3fO88632 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sema3fO88632 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sema3fO88632 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sema3fO88632 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sema3fO88632 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sema3fO88632 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sema3fO88632 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sema3fO88632 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sema3fO88632 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sema3fO88632 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sema3fO88632 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sema3fO88632 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sema3fO88632 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.4 ms