Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tnnt1O88346 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tnnt1O88346 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tnnt1O88346 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tnnt1O88346 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tnnt1O88346 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tnnt1O88346 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tnnt1O88346 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tnnt1O88346 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tnnt1O88346 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tnnt1O88346 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tnnt1O88346 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tnnt1O88346 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tnnt1O88346 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tnnt1O88346 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tnnt1O88346 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tnnt1O88346 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tnnt1O88346 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tnnt1O88346 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tnnt1O88346 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tnnt1O88346 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Tnnt1O88346 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Tnnt1O88346 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tnnt1O88346 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tnnt1O88346 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tnnt1O88346 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tnnt1O88346 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tnnt1O88346 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tnnt1O88346 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tnnt1O88346 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tnnt1O88346 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tnnt1O88346 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tnnt1O88346 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tnnt1O88346 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tnnt1O88346 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tnnt1O88346 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tnnt1O88346 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Tnnt1O88346 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tnnt1O88346 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tnnt1O88346 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tnnt1O88346 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Tnnt1O88346 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tnnt1O88346 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Tnnt1O88346 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tnnt1O88346 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Tnnt1O88346 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tnnt1O88346 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tnnt1O88346 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tnnt1O88346 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tnnt1O88346 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tnnt1O88346 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tnnt1O88346 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tnnt1O88346 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tnnt1O88346 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tnnt1O88346 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Tnnt1O88346 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tnnt1O88346 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tnnt1O88346 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tnnt1O88346 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tnnt1O88346 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tnnt1O88346 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tnnt1O88346 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tnnt1O88346 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tnnt1O88346 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tnnt1O88346 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tnnt1O88346 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tnnt1O88346 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tnnt1O88346 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tnnt1O88346 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tnnt1O88346 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tnnt1O88346 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tnnt1O88346 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tnnt1O88346 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tnnt1O88346 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tnnt1O88346 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tnnt1O88346 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tnnt1O88346 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tnnt1O88346 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tnnt1O88346 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tnnt1O88346 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tnnt1O88346 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tnnt1O88346 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tnnt1O88346 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tnnt1O88346 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tnnt1O88346 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tnnt1O88346 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tnnt1O88346 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tnnt1O88346 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tnnt1O88346 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tnnt1O88346 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tnnt1O88346 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tnnt1O88346 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tnnt1O88346 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tnnt1O88346 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tnnt1O88346 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tnnt1O88346 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tnnt1O88346 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tnnt1O88346 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tnnt1O88346 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tnnt1O88346 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms