Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Syngr1O55100 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Syngr1O55100 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Syngr1O55100 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Syngr1O55100 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Syngr1O55100 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Syngr1O55100 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Syngr1O55100 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Syngr1O55100 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Syngr1O55100 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Syngr1O55100 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Syngr1O55100 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syngr1O55100 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syngr1O55100 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syngr1O55100 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syngr1O55100 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syngr1O55100 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syngr1O55100 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syngr1O55100 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syngr1O55100 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syngr1O55100 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Syngr1O55100 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Syngr1O55100 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Syngr1O55100 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Syngr1O55100 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Syngr1O55100 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Syngr1O55100 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Syngr1O55100 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Syngr1O55100 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Syngr1O55100 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Syngr1O55100 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Syngr1O55100 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Syngr1O55100 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Syngr1O55100 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Syngr1O55100 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Syngr1O55100 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Syngr1O55100 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Syngr1O55100 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Syngr1O55100 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Syngr1O55100 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Syngr1O55100 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Syngr1O55100 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Syngr1O55100 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Syngr1O55100 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Syngr1O55100 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Syngr1O55100 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Syngr1O55100 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Syngr1O55100 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Syngr1O55100 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Syngr1O55100 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Syngr1O55100 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Syngr1O55100 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Syngr1O55100 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Syngr1O55100 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Syngr1O55100 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Syngr1O55100 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Syngr1O55100 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Syngr1O55100 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Syngr1O55100 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Syngr1O55100 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Syngr1O55100 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Syngr1O55100 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Syngr1O55100 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syngr1O55100 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syngr1O55100 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syngr1O55100 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syngr1O55100 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Syngr1O55100 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Syngr1O55100 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Syngr1O55100 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Syngr1O55100 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Syngr1O55100 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Syngr1O55100 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Syngr1O55100 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Syngr1O55100 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Syngr1O55100 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Syngr1O55100 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Syngr1O55100 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Syngr1O55100 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Syngr1O55100 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Syngr1O55100 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Syngr1O55100 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Syngr1O55100 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Syngr1O55100 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Syngr1O55100 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Syngr1O55100 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Syngr1O55100 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Syngr1O55100 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Syngr1O55100 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Syngr1O55100 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Syngr1O55100 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Syngr1O55100 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Syngr1O55100 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Syngr1O55100 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Syngr1O55100 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Syngr1O55100 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Syngr1O55100 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Syngr1O55100 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Syngr1O55100 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Syngr1O55100 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms