Protein–RNA interactions for Protein: O55003

Bnip3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnip3O55003 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Bnip3O55003 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Bnip3O55003 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Bnip3O55003 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Bnip3O55003 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Bnip3O55003 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Bnip3O55003 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Bnip3O55003 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Bnip3O55003 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Bnip3O55003 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Bnip3O55003 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Bnip3O55003 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
Bnip3O55003 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Bnip3O55003 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Bnip3O55003 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Bnip3O55003 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Bnip3O55003 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Bnip3O55003 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Bnip3O55003 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Bnip3O55003 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Bnip3O55003 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Bnip3O55003 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Bnip3O55003 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Bnip3O55003 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Bnip3O55003 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Bnip3O55003 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Bnip3O55003 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Bnip3O55003 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Bnip3O55003 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Bnip3O55003 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Bnip3O55003 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Bnip3O55003 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Bnip3O55003 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Bnip3O55003 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Bnip3O55003 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Bnip3O55003 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Bnip3O55003 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Bnip3O55003 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Bnip3O55003 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Bnip3O55003 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Bnip3O55003 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Bnip3O55003 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Bnip3O55003 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Bnip3O55003 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Bnip3O55003 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Bnip3O55003 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Bnip3O55003 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Bnip3O55003 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Bnip3O55003 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Bnip3O55003 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Bnip3O55003 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Bnip3O55003 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Bnip3O55003 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Bnip3O55003 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Bnip3O55003 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Bnip3O55003 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Bnip3O55003 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Bnip3O55003 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Bnip3O55003 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Bnip3O55003 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Bnip3O55003 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Bnip3O55003 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Bnip3O55003 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Bnip3O55003 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Bnip3O55003 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Bnip3O55003 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Bnip3O55003 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Bnip3O55003 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Bnip3O55003 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Bnip3O55003 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Bnip3O55003 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Bnip3O55003 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Bnip3O55003 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Bnip3O55003 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Bnip3O55003 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Bnip3O55003 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Bnip3O55003 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Bnip3O55003 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Bnip3O55003 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Bnip3O55003 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Bnip3O55003 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Bnip3O55003 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Bnip3O55003 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Bnip3O55003 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Bnip3O55003 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Bnip3O55003 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Bnip3O55003 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Bnip3O55003 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Bnip3O55003 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Bnip3O55003 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Bnip3O55003 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Bnip3O55003 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Bnip3O55003 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Bnip3O55003 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Bnip3O55003 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Bnip3O55003 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Bnip3O55003 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Bnip3O55003 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Bnip3O55003 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Bnip3O55003 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms