Protein–RNA interactions for Protein: O54887

Tsks, Testis-specific serine kinase substrate, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsksO54887 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TsksO54887 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TsksO54887 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TsksO54887 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TsksO54887 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TsksO54887 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TsksO54887 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TsksO54887 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TsksO54887 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TsksO54887 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TsksO54887 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TsksO54887 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TsksO54887 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TsksO54887 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TsksO54887 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TsksO54887 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TsksO54887 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TsksO54887 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TsksO54887 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TsksO54887 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TsksO54887 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
TsksO54887 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TsksO54887 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
TsksO54887 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TsksO54887 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TsksO54887 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TsksO54887 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TsksO54887 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TsksO54887 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TsksO54887 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TsksO54887 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TsksO54887 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TsksO54887 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TsksO54887 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TsksO54887 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TsksO54887 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
TsksO54887 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TsksO54887 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TsksO54887 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TsksO54887 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TsksO54887 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TsksO54887 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TsksO54887 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TsksO54887 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TsksO54887 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TsksO54887 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TsksO54887 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TsksO54887 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TsksO54887 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TsksO54887 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TsksO54887 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TsksO54887 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TsksO54887 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TsksO54887 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TsksO54887 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TsksO54887 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TsksO54887 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TsksO54887 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TsksO54887 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TsksO54887 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TsksO54887 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TsksO54887 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TsksO54887 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TsksO54887 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TsksO54887 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TsksO54887 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TsksO54887 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TsksO54887 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TsksO54887 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TsksO54887 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TsksO54887 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TsksO54887 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TsksO54887 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TsksO54887 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TsksO54887 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TsksO54887 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TsksO54887 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TsksO54887 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TsksO54887 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TsksO54887 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TsksO54887 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TsksO54887 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TsksO54887 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TsksO54887 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TsksO54887 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TsksO54887 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TsksO54887 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TsksO54887 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TsksO54887 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TsksO54887 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TsksO54887 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TsksO54887 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TsksO54887 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TsksO54887 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TsksO54887 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TsksO54887 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TsksO54887 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TsksO54887 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TsksO54887 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TsksO54887 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 156 ms