Protein–RNA interactions for Protein: O54834

Arhgap6, Rho GTPase-activating protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap6O54834 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Arhgap6O54834 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Arhgap6O54834 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Arhgap6O54834 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Arhgap6O54834 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Arhgap6O54834 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Arhgap6O54834 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Arhgap6O54834 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Arhgap6O54834 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Arhgap6O54834 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Arhgap6O54834 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Arhgap6O54834 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Arhgap6O54834 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Arhgap6O54834 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Arhgap6O54834 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Arhgap6O54834 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Arhgap6O54834 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Arhgap6O54834 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Arhgap6O54834 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Arhgap6O54834 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Arhgap6O54834 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Arhgap6O54834 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Arhgap6O54834 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Arhgap6O54834 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Arhgap6O54834 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Arhgap6O54834 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Arhgap6O54834 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Arhgap6O54834 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Arhgap6O54834 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Arhgap6O54834 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Arhgap6O54834 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Arhgap6O54834 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Arhgap6O54834 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Arhgap6O54834 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Arhgap6O54834 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Arhgap6O54834 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Arhgap6O54834 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Arhgap6O54834 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Arhgap6O54834 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Arhgap6O54834 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Arhgap6O54834 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Arhgap6O54834 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Arhgap6O54834 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Arhgap6O54834 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Arhgap6O54834 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Arhgap6O54834 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Arhgap6O54834 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Arhgap6O54834 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Arhgap6O54834 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Arhgap6O54834 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Arhgap6O54834 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Arhgap6O54834 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Arhgap6O54834 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Arhgap6O54834 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Arhgap6O54834 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Arhgap6O54834 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Arhgap6O54834 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Arhgap6O54834 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Arhgap6O54834 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Arhgap6O54834 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Arhgap6O54834 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Arhgap6O54834 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Arhgap6O54834 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Arhgap6O54834 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Arhgap6O54834 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Arhgap6O54834 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Arhgap6O54834 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Arhgap6O54834 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Arhgap6O54834 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Arhgap6O54834 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Arhgap6O54834 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Arhgap6O54834 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Arhgap6O54834 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Arhgap6O54834 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Arhgap6O54834 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Arhgap6O54834 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Arhgap6O54834 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Arhgap6O54834 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Arhgap6O54834 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Arhgap6O54834 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Arhgap6O54834 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Arhgap6O54834 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Arhgap6O54834 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Arhgap6O54834 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Arhgap6O54834 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Arhgap6O54834 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Arhgap6O54834 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Arhgap6O54834 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Arhgap6O54834 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Arhgap6O54834 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Arhgap6O54834 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Arhgap6O54834 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Arhgap6O54834 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Arhgap6O54834 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Arhgap6O54834 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Arhgap6O54834 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Arhgap6O54834 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Arhgap6O54834 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Arhgap6O54834 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Arhgap6O54834 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms