Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
4930544D05RikJ3QK56 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
4930544D05RikJ3QK56 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
4930544D05RikJ3QK56 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
4930544D05RikJ3QK56 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
4930544D05RikJ3QK56 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
4930544D05RikJ3QK56 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
4930544D05RikJ3QK56 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
4930544D05RikJ3QK56 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
4930544D05RikJ3QK56 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
4930544D05RikJ3QK56 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
4930544D05RikJ3QK56 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
4930544D05RikJ3QK56 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
4930544D05RikJ3QK56 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
4930544D05RikJ3QK56 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
4930544D05RikJ3QK56 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
4930544D05RikJ3QK56 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
4930544D05RikJ3QK56 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
4930544D05RikJ3QK56 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
4930544D05RikJ3QK56 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
4930544D05RikJ3QK56 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
4930544D05RikJ3QK56 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
4930544D05RikJ3QK56 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
4930544D05RikJ3QK56 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
4930544D05RikJ3QK56 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
4930544D05RikJ3QK56 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
4930544D05RikJ3QK56 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
4930544D05RikJ3QK56 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
4930544D05RikJ3QK56 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
4930544D05RikJ3QK56 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
4930544D05RikJ3QK56 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
4930544D05RikJ3QK56 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
4930544D05RikJ3QK56 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
4930544D05RikJ3QK56 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
4930544D05RikJ3QK56 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
4930544D05RikJ3QK56 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
4930544D05RikJ3QK56 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
4930544D05RikJ3QK56 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
4930544D05RikJ3QK56 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
4930544D05RikJ3QK56 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
4930544D05RikJ3QK56 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
4930544D05RikJ3QK56 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
4930544D05RikJ3QK56 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
4930544D05RikJ3QK56 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
4930544D05RikJ3QK56 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
4930544D05RikJ3QK56 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
4930544D05RikJ3QK56 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
4930544D05RikJ3QK56 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
4930544D05RikJ3QK56 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
4930544D05RikJ3QK56 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
4930544D05RikJ3QK56 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
4930544D05RikJ3QK56 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
4930544D05RikJ3QK56 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
4930544D05RikJ3QK56 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
4930544D05RikJ3QK56 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
4930544D05RikJ3QK56 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
4930544D05RikJ3QK56 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
4930544D05RikJ3QK56 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
4930544D05RikJ3QK56 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
4930544D05RikJ3QK56 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
4930544D05RikJ3QK56 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
4930544D05RikJ3QK56 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
4930544D05RikJ3QK56 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
4930544D05RikJ3QK56 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
4930544D05RikJ3QK56 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
4930544D05RikJ3QK56 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
4930544D05RikJ3QK56 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
4930544D05RikJ3QK56 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
4930544D05RikJ3QK56 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
4930544D05RikJ3QK56 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
4930544D05RikJ3QK56 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
4930544D05RikJ3QK56 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
4930544D05RikJ3QK56 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
4930544D05RikJ3QK56 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
4930544D05RikJ3QK56 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
4930544D05RikJ3QK56 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
4930544D05RikJ3QK56 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
4930544D05RikJ3QK56 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
4930544D05RikJ3QK56 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
4930544D05RikJ3QK56 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
4930544D05RikJ3QK56 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
4930544D05RikJ3QK56 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
4930544D05RikJ3QK56 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
4930544D05RikJ3QK56 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
4930544D05RikJ3QK56 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
4930544D05RikJ3QK56 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
4930544D05RikJ3QK56 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
4930544D05RikJ3QK56 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
4930544D05RikJ3QK56 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
4930544D05RikJ3QK56 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
4930544D05RikJ3QK56 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
4930544D05RikJ3QK56 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
4930544D05RikJ3QK56 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
4930544D05RikJ3QK56 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
4930544D05RikJ3QK56 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
4930544D05RikJ3QK56 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
4930544D05RikJ3QK56 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
4930544D05RikJ3QK56 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
4930544D05RikJ3QK56 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
4930544D05RikJ3QK56 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms