Protein–RNA interactions for Protein: G3UVU6

Gm20517, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20517G3UVU6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20517G3UVU6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20517G3UVU6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20517G3UVU6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20517G3UVU6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20517G3UVU6 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20517G3UVU6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20517G3UVU6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20517G3UVU6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20517G3UVU6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20517G3UVU6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20517G3UVU6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20517G3UVU6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20517G3UVU6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20517G3UVU6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20517G3UVU6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm20517G3UVU6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20517G3UVU6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20517G3UVU6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20517G3UVU6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20517G3UVU6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20517G3UVU6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20517G3UVU6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20517G3UVU6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20517G3UVU6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20517G3UVU6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20517G3UVU6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20517G3UVU6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20517G3UVU6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20517G3UVU6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20517G3UVU6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20517G3UVU6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20517G3UVU6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20517G3UVU6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20517G3UVU6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20517G3UVU6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20517G3UVU6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20517G3UVU6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20517G3UVU6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20517G3UVU6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20517G3UVU6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20517G3UVU6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20517G3UVU6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20517G3UVU6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20517G3UVU6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20517G3UVU6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20517G3UVU6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20517G3UVU6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20517G3UVU6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20517G3UVU6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20517G3UVU6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20517G3UVU6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20517G3UVU6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20517G3UVU6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20517G3UVU6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gm20517G3UVU6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20517G3UVU6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20517G3UVU6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20517G3UVU6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20517G3UVU6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20517G3UVU6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20517G3UVU6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20517G3UVU6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20517G3UVU6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20517G3UVU6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20517G3UVU6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20517G3UVU6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20517G3UVU6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20517G3UVU6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20517G3UVU6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20517G3UVU6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20517G3UVU6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20517G3UVU6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20517G3UVU6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20517G3UVU6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20517G3UVU6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20517G3UVU6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20517G3UVU6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20517G3UVU6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20517G3UVU6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20517G3UVU6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20517G3UVU6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20517G3UVU6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20517G3UVU6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20517G3UVU6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20517G3UVU6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20517G3UVU6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm20517G3UVU6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm20517G3UVU6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm20517G3UVU6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm20517G3UVU6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm20517G3UVU6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm20517G3UVU6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm20517G3UVU6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm20517G3UVU6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm20517G3UVU6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm20517G3UVU6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20517G3UVU6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20517G3UVU6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20517G3UVU6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms