Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm8247F6VRJ8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm8247F6VRJ8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm8247F6VRJ8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm8247F6VRJ8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm8247F6VRJ8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm8247F6VRJ8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm8247F6VRJ8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm8247F6VRJ8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm8247F6VRJ8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm8247F6VRJ8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm8247F6VRJ8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm8247F6VRJ8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm8247F6VRJ8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm8247F6VRJ8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm8247F6VRJ8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm8247F6VRJ8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm8247F6VRJ8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm8247F6VRJ8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm8247F6VRJ8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm8247F6VRJ8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm8247F6VRJ8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm8247F6VRJ8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm8247F6VRJ8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm8247F6VRJ8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm8247F6VRJ8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm8247F6VRJ8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm8247F6VRJ8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm8247F6VRJ8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm8247F6VRJ8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm8247F6VRJ8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm8247F6VRJ8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm8247F6VRJ8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm8247F6VRJ8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm8247F6VRJ8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm8247F6VRJ8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm8247F6VRJ8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm8247F6VRJ8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm8247F6VRJ8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm8247F6VRJ8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm8247F6VRJ8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm8247F6VRJ8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm8247F6VRJ8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm8247F6VRJ8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm8247F6VRJ8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gm8247F6VRJ8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gm8247F6VRJ8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm8247F6VRJ8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm8247F6VRJ8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm8247F6VRJ8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm8247F6VRJ8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm8247F6VRJ8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm8247F6VRJ8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm8247F6VRJ8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm8247F6VRJ8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm8247F6VRJ8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gm8247F6VRJ8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm8247F6VRJ8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm8247F6VRJ8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm8247F6VRJ8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gm8247F6VRJ8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm8247F6VRJ8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm8247F6VRJ8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm8247F6VRJ8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm8247F6VRJ8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm8247F6VRJ8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm8247F6VRJ8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm8247F6VRJ8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm8247F6VRJ8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm8247F6VRJ8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm8247F6VRJ8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm8247F6VRJ8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm8247F6VRJ8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm8247F6VRJ8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm8247F6VRJ8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm8247F6VRJ8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm8247F6VRJ8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm8247F6VRJ8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm8247F6VRJ8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm8247F6VRJ8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm8247F6VRJ8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm8247F6VRJ8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm8247F6VRJ8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm8247F6VRJ8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm8247F6VRJ8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm8247F6VRJ8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm8247F6VRJ8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm8247F6VRJ8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm8247F6VRJ8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm8247F6VRJ8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm8247F6VRJ8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm8247F6VRJ8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm8247F6VRJ8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm8247F6VRJ8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm8247F6VRJ8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm8247F6VRJ8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm8247F6VRJ8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm8247F6VRJ8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm8247F6VRJ8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm8247F6VRJ8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms