Protein–RNA interactions for Protein: F6U3N7

Gm21977, Predicted gene 21977 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21977F6U3N7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm21977F6U3N7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gm21977F6U3N7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm21977F6U3N7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm21977F6U3N7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm21977F6U3N7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm21977F6U3N7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm21977F6U3N7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm21977F6U3N7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm21977F6U3N7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm21977F6U3N7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm21977F6U3N7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm21977F6U3N7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm21977F6U3N7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm21977F6U3N7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm21977F6U3N7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm21977F6U3N7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm21977F6U3N7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm21977F6U3N7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm21977F6U3N7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm21977F6U3N7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm21977F6U3N7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm21977F6U3N7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm21977F6U3N7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm21977F6U3N7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm21977F6U3N7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm21977F6U3N7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm21977F6U3N7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm21977F6U3N7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm21977F6U3N7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm21977F6U3N7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm21977F6U3N7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm21977F6U3N7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm21977F6U3N7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm21977F6U3N7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm21977F6U3N7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm21977F6U3N7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm21977F6U3N7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm21977F6U3N7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm21977F6U3N7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm21977F6U3N7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm21977F6U3N7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm21977F6U3N7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm21977F6U3N7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm21977F6U3N7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm21977F6U3N7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm21977F6U3N7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm21977F6U3N7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm21977F6U3N7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm21977F6U3N7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm21977F6U3N7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm21977F6U3N7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm21977F6U3N7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm21977F6U3N7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm21977F6U3N7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm21977F6U3N7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm21977F6U3N7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm21977F6U3N7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm21977F6U3N7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm21977F6U3N7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm21977F6U3N7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm21977F6U3N7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm21977F6U3N7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm21977F6U3N7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm21977F6U3N7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm21977F6U3N7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm21977F6U3N7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm21977F6U3N7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm21977F6U3N7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm21977F6U3N7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm21977F6U3N7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm21977F6U3N7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm21977F6U3N7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm21977F6U3N7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm21977F6U3N7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm21977F6U3N7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm21977F6U3N7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm21977F6U3N7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gm21977F6U3N7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gm21977F6U3N7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm21977F6U3N7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm21977F6U3N7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm21977F6U3N7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm21977F6U3N7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm21977F6U3N7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm21977F6U3N7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm21977F6U3N7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm21977F6U3N7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm21977F6U3N7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gm21977F6U3N7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm21977F6U3N7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm21977F6U3N7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm21977F6U3N7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm21977F6U3N7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm21977F6U3N7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gm21977F6U3N7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm21977F6U3N7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm21977F6U3N7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm21977F6U3N7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm21977F6U3N7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms