Protein–RNA interactions for Protein: E9QLQ1

Defa35, Defensin, alpha, 35, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa35E9QLQ1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa35E9QLQ1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa35E9QLQ1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa35E9QLQ1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa35E9QLQ1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa35E9QLQ1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa35E9QLQ1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa35E9QLQ1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa35E9QLQ1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa35E9QLQ1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa35E9QLQ1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa35E9QLQ1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa35E9QLQ1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa35E9QLQ1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa35E9QLQ1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Defa35E9QLQ1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa35E9QLQ1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa35E9QLQ1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa35E9QLQ1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa35E9QLQ1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa35E9QLQ1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa35E9QLQ1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa35E9QLQ1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa35E9QLQ1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa35E9QLQ1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa35E9QLQ1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa35E9QLQ1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa35E9QLQ1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa35E9QLQ1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa35E9QLQ1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa35E9QLQ1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa35E9QLQ1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa35E9QLQ1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa35E9QLQ1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa35E9QLQ1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa35E9QLQ1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa35E9QLQ1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa35E9QLQ1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa35E9QLQ1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa35E9QLQ1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defa35E9QLQ1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defa35E9QLQ1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defa35E9QLQ1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defa35E9QLQ1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defa35E9QLQ1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defa35E9QLQ1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defa35E9QLQ1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defa35E9QLQ1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defa35E9QLQ1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defa35E9QLQ1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defa35E9QLQ1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defa35E9QLQ1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defa35E9QLQ1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defa35E9QLQ1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defa35E9QLQ1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defa35E9QLQ1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defa35E9QLQ1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defa35E9QLQ1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defa35E9QLQ1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defa35E9QLQ1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defa35E9QLQ1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defa35E9QLQ1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defa35E9QLQ1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defa35E9QLQ1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defa35E9QLQ1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defa35E9QLQ1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Defa35E9QLQ1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Defa35E9QLQ1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Defa35E9QLQ1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Defa35E9QLQ1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Defa35E9QLQ1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Defa35E9QLQ1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Defa35E9QLQ1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Defa35E9QLQ1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Defa35E9QLQ1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Defa35E9QLQ1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Defa35E9QLQ1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Defa35E9QLQ1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Defa35E9QLQ1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa35E9QLQ1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa35E9QLQ1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa35E9QLQ1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa35E9QLQ1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa35E9QLQ1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa35E9QLQ1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa35E9QLQ1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa35E9QLQ1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa35E9QLQ1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa35E9QLQ1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa35E9QLQ1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa35E9QLQ1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa35E9QLQ1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa35E9QLQ1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa35E9QLQ1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa35E9QLQ1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa35E9QLQ1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa35E9QLQ1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa35E9QLQ1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa35E9QLQ1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa35E9QLQ1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms