Protein–RNA interactions for Protein: E9QA15

Cald1, Caldesmon 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cald1E9QA15 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cald1E9QA15 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cald1E9QA15 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Cald1E9QA15 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cald1E9QA15 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cald1E9QA15 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cald1E9QA15 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cald1E9QA15 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cald1E9QA15 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Cald1E9QA15 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cald1E9QA15 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cald1E9QA15 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cald1E9QA15 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cald1E9QA15 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cald1E9QA15 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cald1E9QA15 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Cald1E9QA15 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cald1E9QA15 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cald1E9QA15 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cald1E9QA15 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cald1E9QA15 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cald1E9QA15 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cald1E9QA15 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cald1E9QA15 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cald1E9QA15 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cald1E9QA15 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Cald1E9QA15 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cald1E9QA15 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cald1E9QA15 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cald1E9QA15 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cald1E9QA15 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cald1E9QA15 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cald1E9QA15 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Cald1E9QA15 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cald1E9QA15 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cald1E9QA15 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cald1E9QA15 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cald1E9QA15 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cald1E9QA15 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cald1E9QA15 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cald1E9QA15 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Cald1E9QA15 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Cald1E9QA15 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Cald1E9QA15 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Cald1E9QA15 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Cald1E9QA15 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cald1E9QA15 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cald1E9QA15 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cald1E9QA15 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cald1E9QA15 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cald1E9QA15 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cald1E9QA15 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cald1E9QA15 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cald1E9QA15 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cald1E9QA15 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cald1E9QA15 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cald1E9QA15 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cald1E9QA15 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cald1E9QA15 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cald1E9QA15 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cald1E9QA15 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cald1E9QA15 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cald1E9QA15 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cald1E9QA15 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cald1E9QA15 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cald1E9QA15 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cald1E9QA15 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cald1E9QA15 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cald1E9QA15 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cald1E9QA15 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Cald1E9QA15 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cald1E9QA15 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cald1E9QA15 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cald1E9QA15 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cald1E9QA15 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cald1E9QA15 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cald1E9QA15 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cald1E9QA15 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cald1E9QA15 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cald1E9QA15 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cald1E9QA15 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cald1E9QA15 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cald1E9QA15 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cald1E9QA15 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cald1E9QA15 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cald1E9QA15 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cald1E9QA15 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cald1E9QA15 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cald1E9QA15 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cald1E9QA15 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cald1E9QA15 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cald1E9QA15 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cald1E9QA15 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cald1E9QA15 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cald1E9QA15 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cald1E9QA15 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cald1E9QA15 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cald1E9QA15 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cald1E9QA15 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cald1E9QA15 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 552.1 ms