Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6R7

Utrn, Utrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UtrnE9Q6R7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
UtrnE9Q6R7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
UtrnE9Q6R7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
UtrnE9Q6R7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
UtrnE9Q6R7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
UtrnE9Q6R7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
UtrnE9Q6R7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
UtrnE9Q6R7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
UtrnE9Q6R7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
UtrnE9Q6R7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
UtrnE9Q6R7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
UtrnE9Q6R7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UtrnE9Q6R7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UtrnE9Q6R7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UtrnE9Q6R7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
UtrnE9Q6R7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
UtrnE9Q6R7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
UtrnE9Q6R7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
UtrnE9Q6R7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
UtrnE9Q6R7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
UtrnE9Q6R7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
UtrnE9Q6R7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
UtrnE9Q6R7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
UtrnE9Q6R7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
UtrnE9Q6R7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
UtrnE9Q6R7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
UtrnE9Q6R7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
UtrnE9Q6R7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
UtrnE9Q6R7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
UtrnE9Q6R7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
UtrnE9Q6R7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
UtrnE9Q6R7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UtrnE9Q6R7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UtrnE9Q6R7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
UtrnE9Q6R7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
UtrnE9Q6R7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
UtrnE9Q6R7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
UtrnE9Q6R7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
UtrnE9Q6R7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
UtrnE9Q6R7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
UtrnE9Q6R7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
UtrnE9Q6R7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
UtrnE9Q6R7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
UtrnE9Q6R7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
UtrnE9Q6R7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
UtrnE9Q6R7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
UtrnE9Q6R7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
UtrnE9Q6R7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
UtrnE9Q6R7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
UtrnE9Q6R7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
UtrnE9Q6R7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
UtrnE9Q6R7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
UtrnE9Q6R7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
UtrnE9Q6R7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
UtrnE9Q6R7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
UtrnE9Q6R7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
UtrnE9Q6R7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
UtrnE9Q6R7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
UtrnE9Q6R7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
UtrnE9Q6R7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
UtrnE9Q6R7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
UtrnE9Q6R7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
UtrnE9Q6R7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
UtrnE9Q6R7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
UtrnE9Q6R7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
UtrnE9Q6R7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
UtrnE9Q6R7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
UtrnE9Q6R7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
UtrnE9Q6R7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
UtrnE9Q6R7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
UtrnE9Q6R7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
UtrnE9Q6R7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
UtrnE9Q6R7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
UtrnE9Q6R7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
UtrnE9Q6R7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
UtrnE9Q6R7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
UtrnE9Q6R7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
UtrnE9Q6R7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
UtrnE9Q6R7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
UtrnE9Q6R7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
UtrnE9Q6R7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
UtrnE9Q6R7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
UtrnE9Q6R7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
UtrnE9Q6R7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
UtrnE9Q6R7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
UtrnE9Q6R7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
UtrnE9Q6R7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
UtrnE9Q6R7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
UtrnE9Q6R7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
UtrnE9Q6R7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
UtrnE9Q6R7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
UtrnE9Q6R7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
UtrnE9Q6R7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
UtrnE9Q6R7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
UtrnE9Q6R7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
UtrnE9Q6R7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
UtrnE9Q6R7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
UtrnE9Q6R7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
UtrnE9Q6R7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
UtrnE9Q6R7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms