Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ8

E430018J23Rik, RIKEN cDNA E430018J23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E430018J23RikE9PZQ8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E430018J23RikE9PZQ8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E430018J23RikE9PZQ8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
E430018J23RikE9PZQ8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
E430018J23RikE9PZQ8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
E430018J23RikE9PZQ8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E430018J23RikE9PZQ8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E430018J23RikE9PZQ8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E430018J23RikE9PZQ8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E430018J23RikE9PZQ8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E430018J23RikE9PZQ8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E430018J23RikE9PZQ8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E430018J23RikE9PZQ8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E430018J23RikE9PZQ8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E430018J23RikE9PZQ8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E430018J23RikE9PZQ8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E430018J23RikE9PZQ8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E430018J23RikE9PZQ8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E430018J23RikE9PZQ8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E430018J23RikE9PZQ8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E430018J23RikE9PZQ8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
E430018J23RikE9PZQ8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E430018J23RikE9PZQ8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E430018J23RikE9PZQ8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E430018J23RikE9PZQ8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
E430018J23RikE9PZQ8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E430018J23RikE9PZQ8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E430018J23RikE9PZQ8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E430018J23RikE9PZQ8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E430018J23RikE9PZQ8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
E430018J23RikE9PZQ8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E430018J23RikE9PZQ8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
E430018J23RikE9PZQ8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E430018J23RikE9PZQ8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E430018J23RikE9PZQ8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E430018J23RikE9PZQ8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E430018J23RikE9PZQ8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E430018J23RikE9PZQ8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E430018J23RikE9PZQ8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E430018J23RikE9PZQ8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E430018J23RikE9PZQ8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E430018J23RikE9PZQ8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E430018J23RikE9PZQ8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E430018J23RikE9PZQ8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
E430018J23RikE9PZQ8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E430018J23RikE9PZQ8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E430018J23RikE9PZQ8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E430018J23RikE9PZQ8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E430018J23RikE9PZQ8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E430018J23RikE9PZQ8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E430018J23RikE9PZQ8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E430018J23RikE9PZQ8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E430018J23RikE9PZQ8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E430018J23RikE9PZQ8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
E430018J23RikE9PZQ8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E430018J23RikE9PZQ8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E430018J23RikE9PZQ8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E430018J23RikE9PZQ8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E430018J23RikE9PZQ8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E430018J23RikE9PZQ8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E430018J23RikE9PZQ8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E430018J23RikE9PZQ8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
E430018J23RikE9PZQ8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E430018J23RikE9PZQ8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
E430018J23RikE9PZQ8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
E430018J23RikE9PZQ8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
E430018J23RikE9PZQ8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
E430018J23RikE9PZQ8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
E430018J23RikE9PZQ8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
E430018J23RikE9PZQ8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
E430018J23RikE9PZQ8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
E430018J23RikE9PZQ8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
E430018J23RikE9PZQ8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
E430018J23RikE9PZQ8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
E430018J23RikE9PZQ8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
E430018J23RikE9PZQ8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
E430018J23RikE9PZQ8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
E430018J23RikE9PZQ8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
E430018J23RikE9PZQ8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
E430018J23RikE9PZQ8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
E430018J23RikE9PZQ8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
E430018J23RikE9PZQ8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
E430018J23RikE9PZQ8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
E430018J23RikE9PZQ8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
E430018J23RikE9PZQ8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
E430018J23RikE9PZQ8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
E430018J23RikE9PZQ8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
E430018J23RikE9PZQ8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
E430018J23RikE9PZQ8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
E430018J23RikE9PZQ8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
E430018J23RikE9PZQ8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
E430018J23RikE9PZQ8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E430018J23RikE9PZQ8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E430018J23RikE9PZQ8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E430018J23RikE9PZQ8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E430018J23RikE9PZQ8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E430018J23RikE9PZQ8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E430018J23RikE9PZQ8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E430018J23RikE9PZQ8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E430018J23RikE9PZQ8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.8 ms