Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD1

Ccdc62, Coiled-coil domain-containing protein 62, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc62E9PVD1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc62E9PVD1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc62E9PVD1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc62E9PVD1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc62E9PVD1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc62E9PVD1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc62E9PVD1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc62E9PVD1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc62E9PVD1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc62E9PVD1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc62E9PVD1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc62E9PVD1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc62E9PVD1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc62E9PVD1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc62E9PVD1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc62E9PVD1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc62E9PVD1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc62E9PVD1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc62E9PVD1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc62E9PVD1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc62E9PVD1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc62E9PVD1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc62E9PVD1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc62E9PVD1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc62E9PVD1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc62E9PVD1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc62E9PVD1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc62E9PVD1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc62E9PVD1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc62E9PVD1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc62E9PVD1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc62E9PVD1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc62E9PVD1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc62E9PVD1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc62E9PVD1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc62E9PVD1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc62E9PVD1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc62E9PVD1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc62E9PVD1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc62E9PVD1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc62E9PVD1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc62E9PVD1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc62E9PVD1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc62E9PVD1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc62E9PVD1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc62E9PVD1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc62E9PVD1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc62E9PVD1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc62E9PVD1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc62E9PVD1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc62E9PVD1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc62E9PVD1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc62E9PVD1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc62E9PVD1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc62E9PVD1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc62E9PVD1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc62E9PVD1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc62E9PVD1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc62E9PVD1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc62E9PVD1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc62E9PVD1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc62E9PVD1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc62E9PVD1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc62E9PVD1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc62E9PVD1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc62E9PVD1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc62E9PVD1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc62E9PVD1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc62E9PVD1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc62E9PVD1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc62E9PVD1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc62E9PVD1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc62E9PVD1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc62E9PVD1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc62E9PVD1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc62E9PVD1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc62E9PVD1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc62E9PVD1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc62E9PVD1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc62E9PVD1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc62E9PVD1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc62E9PVD1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc62E9PVD1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc62E9PVD1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc62E9PVD1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc62E9PVD1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc62E9PVD1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc62E9PVD1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc62E9PVD1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc62E9PVD1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc62E9PVD1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc62E9PVD1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc62E9PVD1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc62E9PVD1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc62E9PVD1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc62E9PVD1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc62E9PVD1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc62E9PVD1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc62E9PVD1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc62E9PVD1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms