Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6P9

Ddx43, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 43, mousemouse

Predictions only

Length 646 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx43D3Z6P9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddx43D3Z6P9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx43D3Z6P9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx43D3Z6P9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx43D3Z6P9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx43D3Z6P9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx43D3Z6P9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx43D3Z6P9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx43D3Z6P9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx43D3Z6P9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx43D3Z6P9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx43D3Z6P9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx43D3Z6P9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddx43D3Z6P9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddx43D3Z6P9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddx43D3Z6P9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddx43D3Z6P9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddx43D3Z6P9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ddx43D3Z6P9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ddx43D3Z6P9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ddx43D3Z6P9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ddx43D3Z6P9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ddx43D3Z6P9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx43D3Z6P9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx43D3Z6P9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx43D3Z6P9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx43D3Z6P9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx43D3Z6P9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ddx43D3Z6P9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ddx43D3Z6P9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ddx43D3Z6P9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ddx43D3Z6P9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ddx43D3Z6P9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddx43D3Z6P9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddx43D3Z6P9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddx43D3Z6P9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddx43D3Z6P9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddx43D3Z6P9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ddx43D3Z6P9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ddx43D3Z6P9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ddx43D3Z6P9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ddx43D3Z6P9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ddx43D3Z6P9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ddx43D3Z6P9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ddx43D3Z6P9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ddx43D3Z6P9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ddx43D3Z6P9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ddx43D3Z6P9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ddx43D3Z6P9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ddx43D3Z6P9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ddx43D3Z6P9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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Ddx43D3Z6P9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddx43D3Z6P9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddx43D3Z6P9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddx43D3Z6P9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddx43D3Z6P9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddx43D3Z6P9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddx43D3Z6P9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddx43D3Z6P9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ddx43D3Z6P9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ddx43D3Z6P9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ddx43D3Z6P9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ddx43D3Z6P9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ddx43D3Z6P9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Ddx43D3Z6P9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ddx43D3Z6P9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ddx43D3Z6P9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ddx43D3Z6P9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ddx43D3Z6P9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ddx43D3Z6P9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ddx43D3Z6P9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ddx43D3Z6P9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ddx43D3Z6P9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ddx43D3Z6P9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ddx43D3Z6P9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ddx43D3Z6P9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ddx43D3Z6P9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ddx43D3Z6P9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ddx43D3Z6P9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ddx43D3Z6P9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ddx43D3Z6P9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ddx43D3Z6P9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ddx43D3Z6P9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ddx43D3Z6P9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ddx43D3Z6P9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ddx43D3Z6P9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ddx43D3Z6P9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ddx43D3Z6P9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ddx43D3Z6P9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ddx43D3Z6P9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ddx43D3Z6P9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ddx43D3Z6P9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ddx43D3Z6P9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ddx43D3Z6P9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ddx43D3Z6P9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ddx43D3Z6P9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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