Protein–RNA interactions for Protein: B8JJD6

Fance, Fanconi anemia, complementation group E, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FanceB8JJD6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FanceB8JJD6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FanceB8JJD6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FanceB8JJD6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FanceB8JJD6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FanceB8JJD6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FanceB8JJD6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FanceB8JJD6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FanceB8JJD6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
FanceB8JJD6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FanceB8JJD6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FanceB8JJD6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FanceB8JJD6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FanceB8JJD6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FanceB8JJD6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FanceB8JJD6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FanceB8JJD6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FanceB8JJD6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FanceB8JJD6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FanceB8JJD6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FanceB8JJD6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FanceB8JJD6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FanceB8JJD6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FanceB8JJD6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FanceB8JJD6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
FanceB8JJD6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FanceB8JJD6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FanceB8JJD6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FanceB8JJD6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FanceB8JJD6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FanceB8JJD6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FanceB8JJD6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FanceB8JJD6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FanceB8JJD6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FanceB8JJD6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FanceB8JJD6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FanceB8JJD6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FanceB8JJD6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FanceB8JJD6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FanceB8JJD6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FanceB8JJD6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FanceB8JJD6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FanceB8JJD6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FanceB8JJD6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FanceB8JJD6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FanceB8JJD6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FanceB8JJD6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FanceB8JJD6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FanceB8JJD6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FanceB8JJD6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FanceB8JJD6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FanceB8JJD6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FanceB8JJD6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FanceB8JJD6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FanceB8JJD6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FanceB8JJD6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FanceB8JJD6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FanceB8JJD6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FanceB8JJD6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FanceB8JJD6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FanceB8JJD6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FanceB8JJD6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FanceB8JJD6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FanceB8JJD6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FanceB8JJD6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FanceB8JJD6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
FanceB8JJD6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FanceB8JJD6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FanceB8JJD6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FanceB8JJD6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FanceB8JJD6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FanceB8JJD6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FanceB8JJD6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FanceB8JJD6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FanceB8JJD6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FanceB8JJD6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FanceB8JJD6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FanceB8JJD6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
FanceB8JJD6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FanceB8JJD6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FanceB8JJD6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FanceB8JJD6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FanceB8JJD6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FanceB8JJD6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FanceB8JJD6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FanceB8JJD6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FanceB8JJD6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FanceB8JJD6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FanceB8JJD6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FanceB8JJD6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FanceB8JJD6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FanceB8JJD6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FanceB8JJD6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FanceB8JJD6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FanceB8JJD6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FanceB8JJD6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FanceB8JJD6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FanceB8JJD6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FanceB8JJD6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FanceB8JJD6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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