Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rrn3B2RS91 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rrn3B2RS91 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rrn3B2RS91 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rrn3B2RS91 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rrn3B2RS91 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rrn3B2RS91 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rrn3B2RS91 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rrn3B2RS91 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rrn3B2RS91 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rrn3B2RS91 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rrn3B2RS91 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rrn3B2RS91 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rrn3B2RS91 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rrn3B2RS91 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rrn3B2RS91 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rrn3B2RS91 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rrn3B2RS91 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rrn3B2RS91 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rrn3B2RS91 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rrn3B2RS91 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rrn3B2RS91 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rrn3B2RS91 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rrn3B2RS91 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rrn3B2RS91 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rrn3B2RS91 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rrn3B2RS91 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rrn3B2RS91 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rrn3B2RS91 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rrn3B2RS91 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rrn3B2RS91 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rrn3B2RS91 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rrn3B2RS91 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rrn3B2RS91 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Rrn3B2RS91 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Rrn3B2RS91 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rrn3B2RS91 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rrn3B2RS91 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rrn3B2RS91 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rrn3B2RS91 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rrn3B2RS91 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rrn3B2RS91 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rrn3B2RS91 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rrn3B2RS91 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rrn3B2RS91 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rrn3B2RS91 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rrn3B2RS91 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rrn3B2RS91 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rrn3B2RS91 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rrn3B2RS91 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rrn3B2RS91 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rrn3B2RS91 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rrn3B2RS91 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rrn3B2RS91 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rrn3B2RS91 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rrn3B2RS91 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rrn3B2RS91 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rrn3B2RS91 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rrn3B2RS91 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rrn3B2RS91 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rrn3B2RS91 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rrn3B2RS91 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rrn3B2RS91 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rrn3B2RS91 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rrn3B2RS91 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rrn3B2RS91 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rrn3B2RS91 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Rrn3B2RS91 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rrn3B2RS91 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rrn3B2RS91 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rrn3B2RS91 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rrn3B2RS91 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rrn3B2RS91 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rrn3B2RS91 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rrn3B2RS91 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rrn3B2RS91 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rrn3B2RS91 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rrn3B2RS91 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rrn3B2RS91 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rrn3B2RS91 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rrn3B2RS91 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rrn3B2RS91 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rrn3B2RS91 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rrn3B2RS91 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rrn3B2RS91 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rrn3B2RS91 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rrn3B2RS91 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rrn3B2RS91 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rrn3B2RS91 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rrn3B2RS91 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rrn3B2RS91 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rrn3B2RS91 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rrn3B2RS91 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rrn3B2RS91 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rrn3B2RS91 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rrn3B2RS91 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rrn3B2RS91 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rrn3B2RS91 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rrn3B2RS91 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rrn3B2RS91 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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