Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem238A9JSM3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem238A9JSM3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem238A9JSM3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem238A9JSM3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem238A9JSM3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem238A9JSM3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem238A9JSM3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem238A9JSM3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem238A9JSM3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem238A9JSM3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem238A9JSM3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem238A9JSM3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem238A9JSM3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem238A9JSM3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem238A9JSM3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem238A9JSM3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem238A9JSM3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem238A9JSM3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem238A9JSM3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem238A9JSM3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem238A9JSM3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem238A9JSM3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem238A9JSM3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem238A9JSM3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem238A9JSM3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem238A9JSM3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem238A9JSM3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem238A9JSM3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem238A9JSM3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem238A9JSM3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem238A9JSM3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem238A9JSM3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem238A9JSM3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem238A9JSM3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem238A9JSM3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem238A9JSM3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem238A9JSM3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem238A9JSM3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem238A9JSM3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem238A9JSM3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem238A9JSM3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem238A9JSM3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem238A9JSM3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem238A9JSM3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem238A9JSM3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem238A9JSM3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem238A9JSM3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem238A9JSM3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem238A9JSM3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem238A9JSM3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem238A9JSM3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem238A9JSM3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem238A9JSM3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem238A9JSM3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem238A9JSM3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem238A9JSM3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem238A9JSM3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem238A9JSM3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem238A9JSM3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem238A9JSM3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem238A9JSM3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem238A9JSM3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem238A9JSM3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem238A9JSM3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem238A9JSM3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem238A9JSM3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem238A9JSM3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem238A9JSM3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem238A9JSM3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem238A9JSM3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem238A9JSM3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem238A9JSM3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem238A9JSM3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem238A9JSM3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem238A9JSM3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem238A9JSM3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem238A9JSM3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem238A9JSM3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem238A9JSM3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem238A9JSM3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem238A9JSM3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem238A9JSM3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem238A9JSM3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem238A9JSM3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem238A9JSM3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem238A9JSM3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem238A9JSM3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem238A9JSM3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem238A9JSM3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem238A9JSM3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tmem238A9JSM3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem238A9JSM3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem238A9JSM3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem238A9JSM3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem238A9JSM3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem238A9JSM3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem238A9JSM3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem238A9JSM3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem238A9JSM3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.8 ms