Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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