Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WPV9

1700019A02Rik, RIKEN cDNA 1700019A02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700019A02RikA0A087WPV9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
1700019A02RikA0A087WPV9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
1700019A02RikA0A087WPV9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
1700019A02RikA0A087WPV9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
1700019A02RikA0A087WPV9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
1700019A02RikA0A087WPV9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
1700019A02RikA0A087WPV9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
1700019A02RikA0A087WPV9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
1700019A02RikA0A087WPV9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
1700019A02RikA0A087WPV9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
1700019A02RikA0A087WPV9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
1700019A02RikA0A087WPV9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
1700019A02RikA0A087WPV9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
1700019A02RikA0A087WPV9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
1700019A02RikA0A087WPV9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms