Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN9

Rhox2d, MCG125586, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox2dW4VSN9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rhox2dW4VSN9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rhox2dW4VSN9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rhox2dW4VSN9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rhox2dW4VSN9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rhox2dW4VSN9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rhox2dW4VSN9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rhox2dW4VSN9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rhox2dW4VSN9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rhox2dW4VSN9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rhox2dW4VSN9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rhox2dW4VSN9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rhox2dW4VSN9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rhox2dW4VSN9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rhox2dW4VSN9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rhox2dW4VSN9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rhox2dW4VSN9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rhox2dW4VSN9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Rhox2dW4VSN9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Rhox2dW4VSN9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rhox2dW4VSN9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rhox2dW4VSN9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rhox2dW4VSN9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rhox2dW4VSN9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rhox2dW4VSN9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Rhox2dW4VSN9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rhox2dW4VSN9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rhox2dW4VSN9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rhox2dW4VSN9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Rhox2dW4VSN9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rhox2dW4VSN9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rhox2dW4VSN9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
Rhox2dW4VSN9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rhox2dW4VSN9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rhox2dW4VSN9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rhox2dW4VSN9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rhox2dW4VSN9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rhox2dW4VSN9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Rhox2dW4VSN9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rhox2dW4VSN9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rhox2dW4VSN9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rhox2dW4VSN9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rhox2dW4VSN9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Rhox2dW4VSN9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rhox2dW4VSN9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rhox2dW4VSN9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rhox2dW4VSN9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rhox2dW4VSN9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rhox2dW4VSN9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rhox2dW4VSN9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rhox2dW4VSN9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rhox2dW4VSN9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rhox2dW4VSN9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rhox2dW4VSN9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rhox2dW4VSN9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rhox2dW4VSN9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rhox2dW4VSN9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rhox2dW4VSN9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rhox2dW4VSN9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rhox2dW4VSN9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rhox2dW4VSN9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rhox2dW4VSN9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rhox2dW4VSN9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Rhox2dW4VSN9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Rhox2dW4VSN9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rhox2dW4VSN9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rhox2dW4VSN9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rhox2dW4VSN9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rhox2dW4VSN9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rhox2dW4VSN9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rhox2dW4VSN9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rhox2dW4VSN9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rhox2dW4VSN9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Rhox2dW4VSN9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rhox2dW4VSN9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rhox2dW4VSN9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Rhox2dW4VSN9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rhox2dW4VSN9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rhox2dW4VSN9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rhox2dW4VSN9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rhox2dW4VSN9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rhox2dW4VSN9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rhox2dW4VSN9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rhox2dW4VSN9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rhox2dW4VSN9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rhox2dW4VSN9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rhox2dW4VSN9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Rhox2dW4VSN9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rhox2dW4VSN9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rhox2dW4VSN9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rhox2dW4VSN9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rhox2dW4VSN9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rhox2dW4VSN9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rhox2dW4VSN9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rhox2dW4VSN9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rhox2dW4VSN9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rhox2dW4VSN9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rhox2dW4VSN9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rhox2dW4VSN9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rhox2dW4VSN9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms