Protein–RNA interactions for Protein: V9GXJ1

Gm28036, Predicted gene, 28036, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28036V9GXJ1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm28036V9GXJ1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm28036V9GXJ1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm28036V9GXJ1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm28036V9GXJ1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm28036V9GXJ1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm28036V9GXJ1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm28036V9GXJ1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm28036V9GXJ1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm28036V9GXJ1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm28036V9GXJ1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm28036V9GXJ1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm28036V9GXJ1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm28036V9GXJ1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm28036V9GXJ1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm28036V9GXJ1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm28036V9GXJ1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm28036V9GXJ1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm28036V9GXJ1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm28036V9GXJ1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm28036V9GXJ1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm28036V9GXJ1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm28036V9GXJ1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm28036V9GXJ1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm28036V9GXJ1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm28036V9GXJ1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm28036V9GXJ1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm28036V9GXJ1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm28036V9GXJ1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm28036V9GXJ1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm28036V9GXJ1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm28036V9GXJ1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm28036V9GXJ1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm28036V9GXJ1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm28036V9GXJ1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm28036V9GXJ1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm28036V9GXJ1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm28036V9GXJ1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm28036V9GXJ1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gm28036V9GXJ1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm28036V9GXJ1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm28036V9GXJ1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm28036V9GXJ1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm28036V9GXJ1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm28036V9GXJ1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm28036V9GXJ1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm28036V9GXJ1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm28036V9GXJ1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm28036V9GXJ1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm28036V9GXJ1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm28036V9GXJ1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm28036V9GXJ1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm28036V9GXJ1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm28036V9GXJ1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm28036V9GXJ1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm28036V9GXJ1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm28036V9GXJ1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm28036V9GXJ1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm28036V9GXJ1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm28036V9GXJ1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm28036V9GXJ1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm28036V9GXJ1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm28036V9GXJ1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm28036V9GXJ1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm28036V9GXJ1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm28036V9GXJ1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm28036V9GXJ1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm28036V9GXJ1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm28036V9GXJ1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm28036V9GXJ1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm28036V9GXJ1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm28036V9GXJ1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm28036V9GXJ1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Gm28036V9GXJ1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm28036V9GXJ1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm28036V9GXJ1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm28036V9GXJ1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm28036V9GXJ1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm28036V9GXJ1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm28036V9GXJ1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm28036V9GXJ1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm28036V9GXJ1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm28036V9GXJ1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm28036V9GXJ1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm28036V9GXJ1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm28036V9GXJ1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm28036V9GXJ1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm28036V9GXJ1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm28036V9GXJ1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm28036V9GXJ1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm28036V9GXJ1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm28036V9GXJ1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm28036V9GXJ1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm28036V9GXJ1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm28036V9GXJ1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm28036V9GXJ1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Gm28036V9GXJ1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Gm28036V9GXJ1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm28036V9GXJ1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm28036V9GXJ1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms