Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Knop1Q9Z2Q2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Knop1Q9Z2Q2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Knop1Q9Z2Q2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Knop1Q9Z2Q2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Knop1Q9Z2Q2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Knop1Q9Z2Q2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Knop1Q9Z2Q2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Knop1Q9Z2Q2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Knop1Q9Z2Q2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Knop1Q9Z2Q2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Knop1Q9Z2Q2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Knop1Q9Z2Q2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Knop1Q9Z2Q2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Knop1Q9Z2Q2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Knop1Q9Z2Q2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Knop1Q9Z2Q2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Knop1Q9Z2Q2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Knop1Q9Z2Q2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Knop1Q9Z2Q2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Knop1Q9Z2Q2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Knop1Q9Z2Q2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Knop1Q9Z2Q2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Knop1Q9Z2Q2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Knop1Q9Z2Q2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Knop1Q9Z2Q2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Knop1Q9Z2Q2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Knop1Q9Z2Q2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Knop1Q9Z2Q2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Knop1Q9Z2Q2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Knop1Q9Z2Q2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Knop1Q9Z2Q2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Knop1Q9Z2Q2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Knop1Q9Z2Q2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Knop1Q9Z2Q2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Knop1Q9Z2Q2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Knop1Q9Z2Q2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Knop1Q9Z2Q2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Knop1Q9Z2Q2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Knop1Q9Z2Q2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Knop1Q9Z2Q2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Knop1Q9Z2Q2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Knop1Q9Z2Q2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Knop1Q9Z2Q2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Knop1Q9Z2Q2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Knop1Q9Z2Q2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Knop1Q9Z2Q2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Knop1Q9Z2Q2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Knop1Q9Z2Q2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Knop1Q9Z2Q2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Knop1Q9Z2Q2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Knop1Q9Z2Q2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Knop1Q9Z2Q2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Knop1Q9Z2Q2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Knop1Q9Z2Q2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Knop1Q9Z2Q2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Knop1Q9Z2Q2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Knop1Q9Z2Q2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Knop1Q9Z2Q2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Knop1Q9Z2Q2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Knop1Q9Z2Q2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Knop1Q9Z2Q2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Knop1Q9Z2Q2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Knop1Q9Z2Q2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Knop1Q9Z2Q2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Knop1Q9Z2Q2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Knop1Q9Z2Q2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Knop1Q9Z2Q2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Knop1Q9Z2Q2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Knop1Q9Z2Q2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Knop1Q9Z2Q2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Knop1Q9Z2Q2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Knop1Q9Z2Q2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Knop1Q9Z2Q2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Knop1Q9Z2Q2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Knop1Q9Z2Q2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Knop1Q9Z2Q2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Knop1Q9Z2Q2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Knop1Q9Z2Q2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Knop1Q9Z2Q2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Knop1Q9Z2Q2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Knop1Q9Z2Q2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Knop1Q9Z2Q2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Knop1Q9Z2Q2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Knop1Q9Z2Q2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Knop1Q9Z2Q2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Knop1Q9Z2Q2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Knop1Q9Z2Q2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Knop1Q9Z2Q2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Knop1Q9Z2Q2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Knop1Q9Z2Q2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Knop1Q9Z2Q2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Knop1Q9Z2Q2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Knop1Q9Z2Q2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Knop1Q9Z2Q2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Knop1Q9Z2Q2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Knop1Q9Z2Q2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Knop1Q9Z2Q2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Knop1Q9Z2Q2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Knop1Q9Z2Q2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms