Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUK4

Rfc2, Replication factor C subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc2Q9WUK4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rfc2Q9WUK4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rfc2Q9WUK4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rfc2Q9WUK4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rfc2Q9WUK4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rfc2Q9WUK4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rfc2Q9WUK4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rfc2Q9WUK4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rfc2Q9WUK4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rfc2Q9WUK4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rfc2Q9WUK4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rfc2Q9WUK4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rfc2Q9WUK4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Rfc2Q9WUK4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rfc2Q9WUK4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rfc2Q9WUK4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rfc2Q9WUK4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rfc2Q9WUK4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rfc2Q9WUK4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rfc2Q9WUK4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rfc2Q9WUK4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rfc2Q9WUK4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rfc2Q9WUK4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rfc2Q9WUK4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rfc2Q9WUK4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rfc2Q9WUK4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rfc2Q9WUK4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rfc2Q9WUK4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Rfc2Q9WUK4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rfc2Q9WUK4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rfc2Q9WUK4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rfc2Q9WUK4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rfc2Q9WUK4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rfc2Q9WUK4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rfc2Q9WUK4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rfc2Q9WUK4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rfc2Q9WUK4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rfc2Q9WUK4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rfc2Q9WUK4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rfc2Q9WUK4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rfc2Q9WUK4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rfc2Q9WUK4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rfc2Q9WUK4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rfc2Q9WUK4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rfc2Q9WUK4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rfc2Q9WUK4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rfc2Q9WUK4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rfc2Q9WUK4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rfc2Q9WUK4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rfc2Q9WUK4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Rfc2Q9WUK4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rfc2Q9WUK4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rfc2Q9WUK4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rfc2Q9WUK4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Rfc2Q9WUK4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rfc2Q9WUK4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rfc2Q9WUK4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rfc2Q9WUK4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rfc2Q9WUK4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rfc2Q9WUK4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rfc2Q9WUK4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Rfc2Q9WUK4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rfc2Q9WUK4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rfc2Q9WUK4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rfc2Q9WUK4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rfc2Q9WUK4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rfc2Q9WUK4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rfc2Q9WUK4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rfc2Q9WUK4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rfc2Q9WUK4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rfc2Q9WUK4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rfc2Q9WUK4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Rfc2Q9WUK4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rfc2Q9WUK4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rfc2Q9WUK4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rfc2Q9WUK4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rfc2Q9WUK4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rfc2Q9WUK4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rfc2Q9WUK4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rfc2Q9WUK4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rfc2Q9WUK4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rfc2Q9WUK4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rfc2Q9WUK4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rfc2Q9WUK4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rfc2Q9WUK4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rfc2Q9WUK4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rfc2Q9WUK4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rfc2Q9WUK4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rfc2Q9WUK4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rfc2Q9WUK4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rfc2Q9WUK4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rfc2Q9WUK4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rfc2Q9WUK4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rfc2Q9WUK4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rfc2Q9WUK4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rfc2Q9WUK4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rfc2Q9WUK4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rfc2Q9WUK4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rfc2Q9WUK4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rfc2Q9WUK4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms