Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG7

Hdgfl3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl3Q9JMG7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdgfl3Q9JMG7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdgfl3Q9JMG7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdgfl3Q9JMG7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdgfl3Q9JMG7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdgfl3Q9JMG7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdgfl3Q9JMG7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdgfl3Q9JMG7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hdgfl3Q9JMG7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hdgfl3Q9JMG7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hdgfl3Q9JMG7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Hdgfl3Q9JMG7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hdgfl3Q9JMG7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hdgfl3Q9JMG7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hdgfl3Q9JMG7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hdgfl3Q9JMG7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hdgfl3Q9JMG7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hdgfl3Q9JMG7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hdgfl3Q9JMG7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hdgfl3Q9JMG7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hdgfl3Q9JMG7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hdgfl3Q9JMG7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hdgfl3Q9JMG7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hdgfl3Q9JMG7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hdgfl3Q9JMG7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hdgfl3Q9JMG7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hdgfl3Q9JMG7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hdgfl3Q9JMG7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hdgfl3Q9JMG7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hdgfl3Q9JMG7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hdgfl3Q9JMG7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hdgfl3Q9JMG7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hdgfl3Q9JMG7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hdgfl3Q9JMG7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hdgfl3Q9JMG7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hdgfl3Q9JMG7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hdgfl3Q9JMG7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Hdgfl3Q9JMG7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hdgfl3Q9JMG7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hdgfl3Q9JMG7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hdgfl3Q9JMG7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hdgfl3Q9JMG7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hdgfl3Q9JMG7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hdgfl3Q9JMG7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hdgfl3Q9JMG7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hdgfl3Q9JMG7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hdgfl3Q9JMG7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hdgfl3Q9JMG7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hdgfl3Q9JMG7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hdgfl3Q9JMG7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hdgfl3Q9JMG7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hdgfl3Q9JMG7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hdgfl3Q9JMG7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hdgfl3Q9JMG7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hdgfl3Q9JMG7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hdgfl3Q9JMG7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hdgfl3Q9JMG7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hdgfl3Q9JMG7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hdgfl3Q9JMG7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hdgfl3Q9JMG7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Hdgfl3Q9JMG7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hdgfl3Q9JMG7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hdgfl3Q9JMG7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hdgfl3Q9JMG7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hdgfl3Q9JMG7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hdgfl3Q9JMG7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hdgfl3Q9JMG7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hdgfl3Q9JMG7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hdgfl3Q9JMG7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hdgfl3Q9JMG7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hdgfl3Q9JMG7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hdgfl3Q9JMG7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hdgfl3Q9JMG7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hdgfl3Q9JMG7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdgfl3Q9JMG7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdgfl3Q9JMG7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdgfl3Q9JMG7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdgfl3Q9JMG7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdgfl3Q9JMG7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdgfl3Q9JMG7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdgfl3Q9JMG7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdgfl3Q9JMG7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdgfl3Q9JMG7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdgfl3Q9JMG7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdgfl3Q9JMG7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdgfl3Q9JMG7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdgfl3Q9JMG7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdgfl3Q9JMG7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdgfl3Q9JMG7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdgfl3Q9JMG7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hdgfl3Q9JMG7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hdgfl3Q9JMG7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Hdgfl3Q9JMG7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hdgfl3Q9JMG7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hdgfl3Q9JMG7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hdgfl3Q9JMG7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hdgfl3Q9JMG7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms