Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM96

Cdc42ep4, Cdc42 effector protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42ep4Q9JM96 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdc42ep4Q9JM96 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdc42ep4Q9JM96 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdc42ep4Q9JM96 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdc42ep4Q9JM96 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdc42ep4Q9JM96 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdc42ep4Q9JM96 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdc42ep4Q9JM96 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdc42ep4Q9JM96 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdc42ep4Q9JM96 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdc42ep4Q9JM96 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdc42ep4Q9JM96 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdc42ep4Q9JM96 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdc42ep4Q9JM96 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdc42ep4Q9JM96 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdc42ep4Q9JM96 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdc42ep4Q9JM96 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdc42ep4Q9JM96 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdc42ep4Q9JM96 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdc42ep4Q9JM96 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdc42ep4Q9JM96 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdc42ep4Q9JM96 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdc42ep4Q9JM96 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdc42ep4Q9JM96 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdc42ep4Q9JM96 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdc42ep4Q9JM96 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdc42ep4Q9JM96 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdc42ep4Q9JM96 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdc42ep4Q9JM96 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdc42ep4Q9JM96 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdc42ep4Q9JM96 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdc42ep4Q9JM96 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdc42ep4Q9JM96 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdc42ep4Q9JM96 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdc42ep4Q9JM96 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdc42ep4Q9JM96 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdc42ep4Q9JM96 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdc42ep4Q9JM96 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdc42ep4Q9JM96 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdc42ep4Q9JM96 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdc42ep4Q9JM96 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdc42ep4Q9JM96 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdc42ep4Q9JM96 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdc42ep4Q9JM96 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdc42ep4Q9JM96 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdc42ep4Q9JM96 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdc42ep4Q9JM96 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdc42ep4Q9JM96 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdc42ep4Q9JM96 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdc42ep4Q9JM96 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdc42ep4Q9JM96 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdc42ep4Q9JM96 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdc42ep4Q9JM96 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdc42ep4Q9JM96 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdc42ep4Q9JM96 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdc42ep4Q9JM96 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdc42ep4Q9JM96 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdc42ep4Q9JM96 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdc42ep4Q9JM96 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdc42ep4Q9JM96 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdc42ep4Q9JM96 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdc42ep4Q9JM96 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdc42ep4Q9JM96 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdc42ep4Q9JM96 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdc42ep4Q9JM96 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdc42ep4Q9JM96 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdc42ep4Q9JM96 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdc42ep4Q9JM96 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdc42ep4Q9JM96 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdc42ep4Q9JM96 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdc42ep4Q9JM96 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdc42ep4Q9JM96 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdc42ep4Q9JM96 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdc42ep4Q9JM96 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdc42ep4Q9JM96 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cdc42ep4Q9JM96 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cdc42ep4Q9JM96 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdc42ep4Q9JM96 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdc42ep4Q9JM96 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdc42ep4Q9JM96 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdc42ep4Q9JM96 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdc42ep4Q9JM96 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdc42ep4Q9JM96 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdc42ep4Q9JM96 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdc42ep4Q9JM96 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdc42ep4Q9JM96 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdc42ep4Q9JM96 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdc42ep4Q9JM96 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdc42ep4Q9JM96 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdc42ep4Q9JM96 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdc42ep4Q9JM96 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdc42ep4Q9JM96 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdc42ep4Q9JM96 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdc42ep4Q9JM96 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdc42ep4Q9JM96 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdc42ep4Q9JM96 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdc42ep4Q9JM96 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdc42ep4Q9JM96 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdc42ep4Q9JM96 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdc42ep4Q9JM96 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.2 ms