Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJW6

Alyref2, Aly/REF export factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alyref2Q9JJW6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Alyref2Q9JJW6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Alyref2Q9JJW6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Alyref2Q9JJW6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Alyref2Q9JJW6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Alyref2Q9JJW6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Alyref2Q9JJW6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Alyref2Q9JJW6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Alyref2Q9JJW6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Alyref2Q9JJW6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Alyref2Q9JJW6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Alyref2Q9JJW6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Alyref2Q9JJW6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Alyref2Q9JJW6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Alyref2Q9JJW6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Alyref2Q9JJW6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Alyref2Q9JJW6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Alyref2Q9JJW6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Alyref2Q9JJW6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Alyref2Q9JJW6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Alyref2Q9JJW6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Alyref2Q9JJW6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Alyref2Q9JJW6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Alyref2Q9JJW6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Alyref2Q9JJW6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Alyref2Q9JJW6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Alyref2Q9JJW6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Alyref2Q9JJW6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Alyref2Q9JJW6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Alyref2Q9JJW6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Alyref2Q9JJW6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Alyref2Q9JJW6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Alyref2Q9JJW6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Alyref2Q9JJW6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Alyref2Q9JJW6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Alyref2Q9JJW6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Alyref2Q9JJW6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Alyref2Q9JJW6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Alyref2Q9JJW6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Alyref2Q9JJW6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Alyref2Q9JJW6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Alyref2Q9JJW6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Alyref2Q9JJW6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Alyref2Q9JJW6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Alyref2Q9JJW6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Alyref2Q9JJW6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Alyref2Q9JJW6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Alyref2Q9JJW6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Alyref2Q9JJW6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Alyref2Q9JJW6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Alyref2Q9JJW6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Alyref2Q9JJW6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Alyref2Q9JJW6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Alyref2Q9JJW6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Alyref2Q9JJW6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Alyref2Q9JJW6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Alyref2Q9JJW6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Alyref2Q9JJW6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Alyref2Q9JJW6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Alyref2Q9JJW6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Alyref2Q9JJW6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Alyref2Q9JJW6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Alyref2Q9JJW6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Alyref2Q9JJW6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Alyref2Q9JJW6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Alyref2Q9JJW6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Alyref2Q9JJW6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Alyref2Q9JJW6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Alyref2Q9JJW6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Alyref2Q9JJW6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Alyref2Q9JJW6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Alyref2Q9JJW6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Alyref2Q9JJW6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Alyref2Q9JJW6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Alyref2Q9JJW6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Alyref2Q9JJW6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Alyref2Q9JJW6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Alyref2Q9JJW6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Alyref2Q9JJW6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Alyref2Q9JJW6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Alyref2Q9JJW6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Alyref2Q9JJW6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Alyref2Q9JJW6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Alyref2Q9JJW6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Alyref2Q9JJW6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Alyref2Q9JJW6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Alyref2Q9JJW6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Alyref2Q9JJW6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Alyref2Q9JJW6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Alyref2Q9JJW6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Alyref2Q9JJW6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Alyref2Q9JJW6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Alyref2Q9JJW6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Alyref2Q9JJW6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Alyref2Q9JJW6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Alyref2Q9JJW6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Alyref2Q9JJW6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Alyref2Q9JJW6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Alyref2Q9JJW6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Alyref2Q9JJW6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
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