Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJV4

Cacng4, Voltage-dependent calcium channel gamma-4 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng4Q9JJV4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cacng4Q9JJV4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cacng4Q9JJV4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cacng4Q9JJV4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cacng4Q9JJV4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cacng4Q9JJV4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cacng4Q9JJV4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cacng4Q9JJV4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cacng4Q9JJV4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cacng4Q9JJV4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cacng4Q9JJV4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cacng4Q9JJV4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Cacng4Q9JJV4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cacng4Q9JJV4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Cacng4Q9JJV4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cacng4Q9JJV4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cacng4Q9JJV4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cacng4Q9JJV4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cacng4Q9JJV4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cacng4Q9JJV4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cacng4Q9JJV4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cacng4Q9JJV4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cacng4Q9JJV4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cacng4Q9JJV4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cacng4Q9JJV4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cacng4Q9JJV4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cacng4Q9JJV4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cacng4Q9JJV4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cacng4Q9JJV4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Cacng4Q9JJV4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cacng4Q9JJV4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cacng4Q9JJV4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cacng4Q9JJV4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cacng4Q9JJV4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cacng4Q9JJV4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Cacng4Q9JJV4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cacng4Q9JJV4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cacng4Q9JJV4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cacng4Q9JJV4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cacng4Q9JJV4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cacng4Q9JJV4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cacng4Q9JJV4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cacng4Q9JJV4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cacng4Q9JJV4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cacng4Q9JJV4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cacng4Q9JJV4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cacng4Q9JJV4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cacng4Q9JJV4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cacng4Q9JJV4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Cacng4Q9JJV4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cacng4Q9JJV4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cacng4Q9JJV4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cacng4Q9JJV4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cacng4Q9JJV4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cacng4Q9JJV4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cacng4Q9JJV4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cacng4Q9JJV4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cacng4Q9JJV4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cacng4Q9JJV4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cacng4Q9JJV4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cacng4Q9JJV4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cacng4Q9JJV4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cacng4Q9JJV4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cacng4Q9JJV4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cacng4Q9JJV4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cacng4Q9JJV4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cacng4Q9JJV4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cacng4Q9JJV4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cacng4Q9JJV4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cacng4Q9JJV4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cacng4Q9JJV4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cacng4Q9JJV4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cacng4Q9JJV4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cacng4Q9JJV4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cacng4Q9JJV4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cacng4Q9JJV4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cacng4Q9JJV4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cacng4Q9JJV4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cacng4Q9JJV4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Cacng4Q9JJV4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cacng4Q9JJV4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cacng4Q9JJV4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cacng4Q9JJV4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cacng4Q9JJV4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cacng4Q9JJV4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cacng4Q9JJV4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cacng4Q9JJV4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cacng4Q9JJV4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cacng4Q9JJV4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cacng4Q9JJV4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cacng4Q9JJV4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Cacng4Q9JJV4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cacng4Q9JJV4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cacng4Q9JJV4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cacng4Q9JJV4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cacng4Q9JJV4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cacng4Q9JJV4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cacng4Q9JJV4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cacng4Q9JJV4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cacng4Q9JJV4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms