Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIK5

Ddx21, Nucleolar RNA helicase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx21Q9JIK5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ddx21Q9JIK5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ddx21Q9JIK5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ddx21Q9JIK5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ddx21Q9JIK5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ddx21Q9JIK5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ddx21Q9JIK5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ddx21Q9JIK5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ddx21Q9JIK5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ddx21Q9JIK5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ddx21Q9JIK5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ddx21Q9JIK5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ddx21Q9JIK5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ddx21Q9JIK5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ddx21Q9JIK5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ddx21Q9JIK5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ddx21Q9JIK5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ddx21Q9JIK5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ddx21Q9JIK5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ddx21Q9JIK5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ddx21Q9JIK5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ddx21Q9JIK5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ddx21Q9JIK5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ddx21Q9JIK5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ddx21Q9JIK5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ddx21Q9JIK5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ddx21Q9JIK5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ddx21Q9JIK5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ddx21Q9JIK5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ddx21Q9JIK5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ddx21Q9JIK5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ddx21Q9JIK5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ddx21Q9JIK5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ddx21Q9JIK5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ddx21Q9JIK5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ddx21Q9JIK5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ddx21Q9JIK5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ddx21Q9JIK5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ddx21Q9JIK5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ddx21Q9JIK5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ddx21Q9JIK5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ddx21Q9JIK5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ddx21Q9JIK5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ddx21Q9JIK5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ddx21Q9JIK5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ddx21Q9JIK5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ddx21Q9JIK5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ddx21Q9JIK5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ddx21Q9JIK5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ddx21Q9JIK5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ddx21Q9JIK5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ddx21Q9JIK5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ddx21Q9JIK5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ddx21Q9JIK5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ddx21Q9JIK5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ddx21Q9JIK5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ddx21Q9JIK5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ddx21Q9JIK5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ddx21Q9JIK5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ddx21Q9JIK5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ddx21Q9JIK5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ddx21Q9JIK5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ddx21Q9JIK5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ddx21Q9JIK5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ddx21Q9JIK5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ddx21Q9JIK5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ddx21Q9JIK5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ddx21Q9JIK5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ddx21Q9JIK5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ddx21Q9JIK5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ddx21Q9JIK5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ddx21Q9JIK5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ddx21Q9JIK5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ddx21Q9JIK5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ddx21Q9JIK5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ddx21Q9JIK5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ddx21Q9JIK5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ddx21Q9JIK5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ddx21Q9JIK5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ddx21Q9JIK5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ddx21Q9JIK5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ddx21Q9JIK5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ddx21Q9JIK5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ddx21Q9JIK5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ddx21Q9JIK5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ddx21Q9JIK5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ddx21Q9JIK5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ddx21Q9JIK5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ddx21Q9JIK5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ddx21Q9JIK5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ddx21Q9JIK5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ddx21Q9JIK5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ddx21Q9JIK5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ddx21Q9JIK5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ddx21Q9JIK5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ddx21Q9JIK5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ddx21Q9JIK5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ddx21Q9JIK5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ddx21Q9JIK5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ddx21Q9JIK5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 173.7 ms