Protein–RNA interactions for Protein: Q9JID9

Sh2b2, SH2B adapter protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2b2Q9JID9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sh2b2Q9JID9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sh2b2Q9JID9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sh2b2Q9JID9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sh2b2Q9JID9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sh2b2Q9JID9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sh2b2Q9JID9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sh2b2Q9JID9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Sh2b2Q9JID9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sh2b2Q9JID9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sh2b2Q9JID9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sh2b2Q9JID9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sh2b2Q9JID9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sh2b2Q9JID9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sh2b2Q9JID9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sh2b2Q9JID9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sh2b2Q9JID9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Sh2b2Q9JID9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sh2b2Q9JID9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sh2b2Q9JID9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sh2b2Q9JID9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sh2b2Q9JID9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sh2b2Q9JID9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sh2b2Q9JID9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sh2b2Q9JID9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sh2b2Q9JID9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sh2b2Q9JID9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Sh2b2Q9JID9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sh2b2Q9JID9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sh2b2Q9JID9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sh2b2Q9JID9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sh2b2Q9JID9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sh2b2Q9JID9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sh2b2Q9JID9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sh2b2Q9JID9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sh2b2Q9JID9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sh2b2Q9JID9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sh2b2Q9JID9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sh2b2Q9JID9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sh2b2Q9JID9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sh2b2Q9JID9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sh2b2Q9JID9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Sh2b2Q9JID9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sh2b2Q9JID9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sh2b2Q9JID9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Sh2b2Q9JID9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sh2b2Q9JID9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sh2b2Q9JID9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sh2b2Q9JID9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sh2b2Q9JID9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sh2b2Q9JID9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sh2b2Q9JID9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sh2b2Q9JID9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sh2b2Q9JID9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sh2b2Q9JID9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sh2b2Q9JID9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sh2b2Q9JID9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sh2b2Q9JID9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sh2b2Q9JID9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sh2b2Q9JID9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Sh2b2Q9JID9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sh2b2Q9JID9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sh2b2Q9JID9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sh2b2Q9JID9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sh2b2Q9JID9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sh2b2Q9JID9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Sh2b2Q9JID9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sh2b2Q9JID9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sh2b2Q9JID9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sh2b2Q9JID9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sh2b2Q9JID9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sh2b2Q9JID9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sh2b2Q9JID9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sh2b2Q9JID9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sh2b2Q9JID9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sh2b2Q9JID9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sh2b2Q9JID9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sh2b2Q9JID9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sh2b2Q9JID9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sh2b2Q9JID9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sh2b2Q9JID9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sh2b2Q9JID9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sh2b2Q9JID9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sh2b2Q9JID9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sh2b2Q9JID9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sh2b2Q9JID9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sh2b2Q9JID9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Sh2b2Q9JID9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sh2b2Q9JID9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sh2b2Q9JID9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sh2b2Q9JID9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sh2b2Q9JID9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sh2b2Q9JID9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sh2b2Q9JID9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sh2b2Q9JID9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Sh2b2Q9JID9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sh2b2Q9JID9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sh2b2Q9JID9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sh2b2Q9JID9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sh2b2Q9JID9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms