Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OtofQ9ESF1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OtofQ9ESF1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
OtofQ9ESF1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
OtofQ9ESF1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
OtofQ9ESF1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
OtofQ9ESF1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
OtofQ9ESF1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
OtofQ9ESF1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
OtofQ9ESF1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
OtofQ9ESF1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
OtofQ9ESF1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
OtofQ9ESF1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
OtofQ9ESF1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OtofQ9ESF1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OtofQ9ESF1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OtofQ9ESF1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
OtofQ9ESF1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
OtofQ9ESF1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
OtofQ9ESF1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OtofQ9ESF1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OtofQ9ESF1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OtofQ9ESF1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OtofQ9ESF1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OtofQ9ESF1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OtofQ9ESF1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OtofQ9ESF1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OtofQ9ESF1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OtofQ9ESF1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
OtofQ9ESF1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OtofQ9ESF1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
OtofQ9ESF1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OtofQ9ESF1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OtofQ9ESF1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
OtofQ9ESF1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OtofQ9ESF1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OtofQ9ESF1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
OtofQ9ESF1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OtofQ9ESF1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OtofQ9ESF1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OtofQ9ESF1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OtofQ9ESF1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
OtofQ9ESF1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OtofQ9ESF1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OtofQ9ESF1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OtofQ9ESF1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
OtofQ9ESF1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
OtofQ9ESF1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OtofQ9ESF1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OtofQ9ESF1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
OtofQ9ESF1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OtofQ9ESF1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OtofQ9ESF1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OtofQ9ESF1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OtofQ9ESF1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OtofQ9ESF1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OtofQ9ESF1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
OtofQ9ESF1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
OtofQ9ESF1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
OtofQ9ESF1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
OtofQ9ESF1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
OtofQ9ESF1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
OtofQ9ESF1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
OtofQ9ESF1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OtofQ9ESF1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OtofQ9ESF1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OtofQ9ESF1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OtofQ9ESF1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
OtofQ9ESF1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OtofQ9ESF1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
OtofQ9ESF1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OtofQ9ESF1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OtofQ9ESF1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
OtofQ9ESF1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OtofQ9ESF1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OtofQ9ESF1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
OtofQ9ESF1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OtofQ9ESF1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OtofQ9ESF1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OtofQ9ESF1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
OtofQ9ESF1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
OtofQ9ESF1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OtofQ9ESF1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OtofQ9ESF1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
OtofQ9ESF1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
OtofQ9ESF1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
OtofQ9ESF1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
OtofQ9ESF1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
OtofQ9ESF1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
OtofQ9ESF1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OtofQ9ESF1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OtofQ9ESF1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OtofQ9ESF1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
OtofQ9ESF1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OtofQ9ESF1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
OtofQ9ESF1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
OtofQ9ESF1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
OtofQ9ESF1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
OtofQ9ESF1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
OtofQ9ESF1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
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