Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERP3

Trim54, Tripartite motif-containing protein 54, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim54Q9ERP3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim54Q9ERP3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim54Q9ERP3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim54Q9ERP3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Trim54Q9ERP3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim54Q9ERP3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim54Q9ERP3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim54Q9ERP3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim54Q9ERP3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim54Q9ERP3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim54Q9ERP3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim54Q9ERP3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim54Q9ERP3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim54Q9ERP3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim54Q9ERP3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim54Q9ERP3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim54Q9ERP3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim54Q9ERP3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim54Q9ERP3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim54Q9ERP3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim54Q9ERP3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim54Q9ERP3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim54Q9ERP3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim54Q9ERP3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim54Q9ERP3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim54Q9ERP3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim54Q9ERP3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim54Q9ERP3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim54Q9ERP3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim54Q9ERP3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim54Q9ERP3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim54Q9ERP3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim54Q9ERP3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim54Q9ERP3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim54Q9ERP3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim54Q9ERP3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim54Q9ERP3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim54Q9ERP3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim54Q9ERP3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim54Q9ERP3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim54Q9ERP3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim54Q9ERP3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim54Q9ERP3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim54Q9ERP3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim54Q9ERP3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim54Q9ERP3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim54Q9ERP3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim54Q9ERP3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim54Q9ERP3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim54Q9ERP3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trim54Q9ERP3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim54Q9ERP3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim54Q9ERP3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim54Q9ERP3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim54Q9ERP3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim54Q9ERP3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim54Q9ERP3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim54Q9ERP3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim54Q9ERP3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim54Q9ERP3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim54Q9ERP3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim54Q9ERP3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim54Q9ERP3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim54Q9ERP3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim54Q9ERP3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim54Q9ERP3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim54Q9ERP3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim54Q9ERP3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim54Q9ERP3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim54Q9ERP3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim54Q9ERP3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim54Q9ERP3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim54Q9ERP3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim54Q9ERP3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim54Q9ERP3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim54Q9ERP3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim54Q9ERP3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim54Q9ERP3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim54Q9ERP3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim54Q9ERP3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim54Q9ERP3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim54Q9ERP3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim54Q9ERP3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim54Q9ERP3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim54Q9ERP3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim54Q9ERP3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim54Q9ERP3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim54Q9ERP3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim54Q9ERP3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim54Q9ERP3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim54Q9ERP3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim54Q9ERP3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Trim54Q9ERP3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Trim54Q9ERP3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim54Q9ERP3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim54Q9ERP3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim54Q9ERP3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim54Q9ERP3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim54Q9ERP3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim54Q9ERP3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
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