Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC3

Cmtr1, Cap-specific mRNA (nucleoside-2'-O-)-methyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtr1Q9DBC3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cmtr1Q9DBC3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cmtr1Q9DBC3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cmtr1Q9DBC3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cmtr1Q9DBC3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cmtr1Q9DBC3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cmtr1Q9DBC3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cmtr1Q9DBC3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cmtr1Q9DBC3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Cmtr1Q9DBC3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cmtr1Q9DBC3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cmtr1Q9DBC3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cmtr1Q9DBC3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Cmtr1Q9DBC3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cmtr1Q9DBC3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cmtr1Q9DBC3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cmtr1Q9DBC3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cmtr1Q9DBC3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cmtr1Q9DBC3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cmtr1Q9DBC3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Cmtr1Q9DBC3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cmtr1Q9DBC3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cmtr1Q9DBC3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Cmtr1Q9DBC3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cmtr1Q9DBC3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cmtr1Q9DBC3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cmtr1Q9DBC3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cmtr1Q9DBC3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cmtr1Q9DBC3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cmtr1Q9DBC3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cmtr1Q9DBC3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cmtr1Q9DBC3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cmtr1Q9DBC3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cmtr1Q9DBC3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cmtr1Q9DBC3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cmtr1Q9DBC3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cmtr1Q9DBC3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cmtr1Q9DBC3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cmtr1Q9DBC3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cmtr1Q9DBC3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cmtr1Q9DBC3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cmtr1Q9DBC3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cmtr1Q9DBC3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Cmtr1Q9DBC3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cmtr1Q9DBC3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cmtr1Q9DBC3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cmtr1Q9DBC3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cmtr1Q9DBC3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cmtr1Q9DBC3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cmtr1Q9DBC3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cmtr1Q9DBC3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cmtr1Q9DBC3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cmtr1Q9DBC3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cmtr1Q9DBC3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cmtr1Q9DBC3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cmtr1Q9DBC3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cmtr1Q9DBC3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cmtr1Q9DBC3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cmtr1Q9DBC3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cmtr1Q9DBC3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cmtr1Q9DBC3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cmtr1Q9DBC3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cmtr1Q9DBC3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cmtr1Q9DBC3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Cmtr1Q9DBC3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cmtr1Q9DBC3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cmtr1Q9DBC3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cmtr1Q9DBC3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cmtr1Q9DBC3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cmtr1Q9DBC3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cmtr1Q9DBC3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cmtr1Q9DBC3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cmtr1Q9DBC3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cmtr1Q9DBC3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cmtr1Q9DBC3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cmtr1Q9DBC3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Cmtr1Q9DBC3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cmtr1Q9DBC3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cmtr1Q9DBC3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cmtr1Q9DBC3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cmtr1Q9DBC3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cmtr1Q9DBC3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cmtr1Q9DBC3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cmtr1Q9DBC3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cmtr1Q9DBC3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cmtr1Q9DBC3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cmtr1Q9DBC3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cmtr1Q9DBC3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cmtr1Q9DBC3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cmtr1Q9DBC3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cmtr1Q9DBC3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cmtr1Q9DBC3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cmtr1Q9DBC3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cmtr1Q9DBC3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cmtr1Q9DBC3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cmtr1Q9DBC3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cmtr1Q9DBC3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cmtr1Q9DBC3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cmtr1Q9DBC3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cmtr1Q9DBC3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms