Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N2

Cldn34b2, Claudin 34B2, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b2Q9D9N2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cldn34b2Q9D9N2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cldn34b2Q9D9N2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cldn34b2Q9D9N2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cldn34b2Q9D9N2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cldn34b2Q9D9N2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cldn34b2Q9D9N2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cldn34b2Q9D9N2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cldn34b2Q9D9N2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Cldn34b2Q9D9N2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cldn34b2Q9D9N2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cldn34b2Q9D9N2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cldn34b2Q9D9N2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cldn34b2Q9D9N2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cldn34b2Q9D9N2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldn34b2Q9D9N2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldn34b2Q9D9N2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldn34b2Q9D9N2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldn34b2Q9D9N2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldn34b2Q9D9N2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cldn34b2Q9D9N2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cldn34b2Q9D9N2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cldn34b2Q9D9N2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cldn34b2Q9D9N2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cldn34b2Q9D9N2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Cldn34b2Q9D9N2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cldn34b2Q9D9N2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cldn34b2Q9D9N2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cldn34b2Q9D9N2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cldn34b2Q9D9N2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cldn34b2Q9D9N2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cldn34b2Q9D9N2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cldn34b2Q9D9N2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cldn34b2Q9D9N2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldn34b2Q9D9N2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldn34b2Q9D9N2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldn34b2Q9D9N2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldn34b2Q9D9N2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldn34b2Q9D9N2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Cldn34b2Q9D9N2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cldn34b2Q9D9N2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cldn34b2Q9D9N2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cldn34b2Q9D9N2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cldn34b2Q9D9N2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cldn34b2Q9D9N2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cldn34b2Q9D9N2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cldn34b2Q9D9N2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cldn34b2Q9D9N2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cldn34b2Q9D9N2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cldn34b2Q9D9N2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cldn34b2Q9D9N2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cldn34b2Q9D9N2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cldn34b2Q9D9N2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cldn34b2Q9D9N2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cldn34b2Q9D9N2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cldn34b2Q9D9N2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cldn34b2Q9D9N2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cldn34b2Q9D9N2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cldn34b2Q9D9N2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Cldn34b2Q9D9N2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Cldn34b2Q9D9N2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cldn34b2Q9D9N2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cldn34b2Q9D9N2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cldn34b2Q9D9N2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cldn34b2Q9D9N2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cldn34b2Q9D9N2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cldn34b2Q9D9N2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Cldn34b2Q9D9N2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cldn34b2Q9D9N2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cldn34b2Q9D9N2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cldn34b2Q9D9N2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cldn34b2Q9D9N2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cldn34b2Q9D9N2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cldn34b2Q9D9N2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cldn34b2Q9D9N2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cldn34b2Q9D9N2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cldn34b2Q9D9N2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Cldn34b2Q9D9N2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cldn34b2Q9D9N2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cldn34b2Q9D9N2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cldn34b2Q9D9N2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cldn34b2Q9D9N2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cldn34b2Q9D9N2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cldn34b2Q9D9N2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cldn34b2Q9D9N2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cldn34b2Q9D9N2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cldn34b2Q9D9N2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cldn34b2Q9D9N2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cldn34b2Q9D9N2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cldn34b2Q9D9N2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cldn34b2Q9D9N2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cldn34b2Q9D9N2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cldn34b2Q9D9N2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cldn34b2Q9D9N2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cldn34b2Q9D9N2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cldn34b2Q9D9N2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cldn34b2Q9D9N2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cldn34b2Q9D9N2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cldn34b2Q9D9N2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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