Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M9

Rnf138rt1, RIKEN cDNA 1700045I19, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138rt1Q9D9M9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf138rt1Q9D9M9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf138rt1Q9D9M9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnf138rt1Q9D9M9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf138rt1Q9D9M9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf138rt1Q9D9M9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rnf138rt1Q9D9M9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf138rt1Q9D9M9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf138rt1Q9D9M9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf138rt1Q9D9M9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf138rt1Q9D9M9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rnf138rt1Q9D9M9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms