Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Alkbh4Q9D8F1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Alkbh4Q9D8F1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Alkbh4Q9D8F1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Alkbh4Q9D8F1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Alkbh4Q9D8F1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Alkbh4Q9D8F1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Alkbh4Q9D8F1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Alkbh4Q9D8F1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Alkbh4Q9D8F1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Alkbh4Q9D8F1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Alkbh4Q9D8F1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Alkbh4Q9D8F1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Alkbh4Q9D8F1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Alkbh4Q9D8F1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Alkbh4Q9D8F1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Alkbh4Q9D8F1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Alkbh4Q9D8F1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Alkbh4Q9D8F1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Alkbh4Q9D8F1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Alkbh4Q9D8F1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Alkbh4Q9D8F1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Alkbh4Q9D8F1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Alkbh4Q9D8F1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Alkbh4Q9D8F1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Alkbh4Q9D8F1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Alkbh4Q9D8F1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Alkbh4Q9D8F1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Alkbh4Q9D8F1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Alkbh4Q9D8F1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Alkbh4Q9D8F1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Alkbh4Q9D8F1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Alkbh4Q9D8F1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Alkbh4Q9D8F1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Alkbh4Q9D8F1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Alkbh4Q9D8F1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Alkbh4Q9D8F1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Alkbh4Q9D8F1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Alkbh4Q9D8F1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Alkbh4Q9D8F1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Alkbh4Q9D8F1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Alkbh4Q9D8F1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Alkbh4Q9D8F1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Alkbh4Q9D8F1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Alkbh4Q9D8F1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Alkbh4Q9D8F1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Alkbh4Q9D8F1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Alkbh4Q9D8F1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Alkbh4Q9D8F1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Alkbh4Q9D8F1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Alkbh4Q9D8F1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Alkbh4Q9D8F1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Alkbh4Q9D8F1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Alkbh4Q9D8F1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Alkbh4Q9D8F1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Alkbh4Q9D8F1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Alkbh4Q9D8F1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Alkbh4Q9D8F1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Alkbh4Q9D8F1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Alkbh4Q9D8F1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Alkbh4Q9D8F1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Alkbh4Q9D8F1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Alkbh4Q9D8F1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Alkbh4Q9D8F1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Alkbh4Q9D8F1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Alkbh4Q9D8F1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Alkbh4Q9D8F1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Alkbh4Q9D8F1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Alkbh4Q9D8F1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Alkbh4Q9D8F1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Alkbh4Q9D8F1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Alkbh4Q9D8F1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Alkbh4Q9D8F1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Alkbh4Q9D8F1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Alkbh4Q9D8F1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Alkbh4Q9D8F1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Alkbh4Q9D8F1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Alkbh4Q9D8F1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Alkbh4Q9D8F1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Alkbh4Q9D8F1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Alkbh4Q9D8F1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Alkbh4Q9D8F1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Alkbh4Q9D8F1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Alkbh4Q9D8F1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Alkbh4Q9D8F1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Alkbh4Q9D8F1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Alkbh4Q9D8F1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Alkbh4Q9D8F1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Alkbh4Q9D8F1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Alkbh4Q9D8F1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Alkbh4Q9D8F1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Alkbh4Q9D8F1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Alkbh4Q9D8F1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Alkbh4Q9D8F1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Alkbh4Q9D8F1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Alkbh4Q9D8F1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Alkbh4Q9D8F1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Alkbh4Q9D8F1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Alkbh4Q9D8F1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Alkbh4Q9D8F1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms