Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7W4

Tspan17, Tetraspanin-17, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan17Q9D7W4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tspan17Q9D7W4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tspan17Q9D7W4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tspan17Q9D7W4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tspan17Q9D7W4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tspan17Q9D7W4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tspan17Q9D7W4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tspan17Q9D7W4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Tspan17Q9D7W4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tspan17Q9D7W4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tspan17Q9D7W4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tspan17Q9D7W4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tspan17Q9D7W4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tspan17Q9D7W4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tspan17Q9D7W4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tspan17Q9D7W4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tspan17Q9D7W4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tspan17Q9D7W4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tspan17Q9D7W4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tspan17Q9D7W4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tspan17Q9D7W4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tspan17Q9D7W4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tspan17Q9D7W4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tspan17Q9D7W4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tspan17Q9D7W4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tspan17Q9D7W4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tspan17Q9D7W4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tspan17Q9D7W4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tspan17Q9D7W4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tspan17Q9D7W4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tspan17Q9D7W4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tspan17Q9D7W4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tspan17Q9D7W4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tspan17Q9D7W4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tspan17Q9D7W4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tspan17Q9D7W4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tspan17Q9D7W4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tspan17Q9D7W4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tspan17Q9D7W4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tspan17Q9D7W4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tspan17Q9D7W4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tspan17Q9D7W4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Tspan17Q9D7W4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tspan17Q9D7W4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tspan17Q9D7W4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tspan17Q9D7W4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Tspan17Q9D7W4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tspan17Q9D7W4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tspan17Q9D7W4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tspan17Q9D7W4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tspan17Q9D7W4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Tspan17Q9D7W4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tspan17Q9D7W4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tspan17Q9D7W4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tspan17Q9D7W4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tspan17Q9D7W4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tspan17Q9D7W4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tspan17Q9D7W4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tspan17Q9D7W4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tspan17Q9D7W4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tspan17Q9D7W4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tspan17Q9D7W4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tspan17Q9D7W4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tspan17Q9D7W4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tspan17Q9D7W4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tspan17Q9D7W4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tspan17Q9D7W4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tspan17Q9D7W4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tspan17Q9D7W4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tspan17Q9D7W4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tspan17Q9D7W4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tspan17Q9D7W4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tspan17Q9D7W4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tspan17Q9D7W4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tspan17Q9D7W4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tspan17Q9D7W4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tspan17Q9D7W4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tspan17Q9D7W4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tspan17Q9D7W4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tspan17Q9D7W4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tspan17Q9D7W4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tspan17Q9D7W4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tspan17Q9D7W4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tspan17Q9D7W4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tspan17Q9D7W4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tspan17Q9D7W4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tspan17Q9D7W4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tspan17Q9D7W4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tspan17Q9D7W4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tspan17Q9D7W4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tspan17Q9D7W4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tspan17Q9D7W4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tspan17Q9D7W4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tspan17Q9D7W4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tspan17Q9D7W4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tspan17Q9D7W4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tspan17Q9D7W4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tspan17Q9D7W4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tspan17Q9D7W4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tspan17Q9D7W4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms