Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F9

Tubb4a, Tubulin beta-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4aQ9D6F9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Tubb4aQ9D6F9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tubb4aQ9D6F9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tubb4aQ9D6F9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tubb4aQ9D6F9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tubb4aQ9D6F9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tubb4aQ9D6F9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tubb4aQ9D6F9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tubb4aQ9D6F9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tubb4aQ9D6F9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tubb4aQ9D6F9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tubb4aQ9D6F9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tubb4aQ9D6F9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tubb4aQ9D6F9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tubb4aQ9D6F9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tubb4aQ9D6F9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tubb4aQ9D6F9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tubb4aQ9D6F9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tubb4aQ9D6F9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tubb4aQ9D6F9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tubb4aQ9D6F9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Tubb4aQ9D6F9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tubb4aQ9D6F9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tubb4aQ9D6F9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tubb4aQ9D6F9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Tubb4aQ9D6F9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tubb4aQ9D6F9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tubb4aQ9D6F9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tubb4aQ9D6F9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tubb4aQ9D6F9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Tubb4aQ9D6F9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tubb4aQ9D6F9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tubb4aQ9D6F9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tubb4aQ9D6F9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tubb4aQ9D6F9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tubb4aQ9D6F9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tubb4aQ9D6F9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tubb4aQ9D6F9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tubb4aQ9D6F9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tubb4aQ9D6F9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tubb4aQ9D6F9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Tubb4aQ9D6F9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tubb4aQ9D6F9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tubb4aQ9D6F9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tubb4aQ9D6F9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tubb4aQ9D6F9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tubb4aQ9D6F9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tubb4aQ9D6F9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tubb4aQ9D6F9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tubb4aQ9D6F9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tubb4aQ9D6F9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tubb4aQ9D6F9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Tubb4aQ9D6F9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tubb4aQ9D6F9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tubb4aQ9D6F9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tubb4aQ9D6F9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tubb4aQ9D6F9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tubb4aQ9D6F9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tubb4aQ9D6F9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tubb4aQ9D6F9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tubb4aQ9D6F9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tubb4aQ9D6F9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tubb4aQ9D6F9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tubb4aQ9D6F9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tubb4aQ9D6F9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tubb4aQ9D6F9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Tubb4aQ9D6F9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tubb4aQ9D6F9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tubb4aQ9D6F9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tubb4aQ9D6F9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tubb4aQ9D6F9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Tubb4aQ9D6F9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tubb4aQ9D6F9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tubb4aQ9D6F9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tubb4aQ9D6F9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tubb4aQ9D6F9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tubb4aQ9D6F9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tubb4aQ9D6F9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tubb4aQ9D6F9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tubb4aQ9D6F9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tubb4aQ9D6F9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Tubb4aQ9D6F9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tubb4aQ9D6F9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tubb4aQ9D6F9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tubb4aQ9D6F9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tubb4aQ9D6F9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tubb4aQ9D6F9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tubb4aQ9D6F9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tubb4aQ9D6F9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tubb4aQ9D6F9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tubb4aQ9D6F9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tubb4aQ9D6F9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tubb4aQ9D6F9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tubb4aQ9D6F9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tubb4aQ9D6F9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Tubb4aQ9D6F9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Tubb4aQ9D6F9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tubb4aQ9D6F9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tubb4aQ9D6F9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tubb4aQ9D6F9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms