Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6B9

Hrct1, Histidine-rich carboxyl terminus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hrct1Q9D6B9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hrct1Q9D6B9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hrct1Q9D6B9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hrct1Q9D6B9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hrct1Q9D6B9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hrct1Q9D6B9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hrct1Q9D6B9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hrct1Q9D6B9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hrct1Q9D6B9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hrct1Q9D6B9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hrct1Q9D6B9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hrct1Q9D6B9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hrct1Q9D6B9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hrct1Q9D6B9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hrct1Q9D6B9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hrct1Q9D6B9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hrct1Q9D6B9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hrct1Q9D6B9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hrct1Q9D6B9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hrct1Q9D6B9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hrct1Q9D6B9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hrct1Q9D6B9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hrct1Q9D6B9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hrct1Q9D6B9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hrct1Q9D6B9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hrct1Q9D6B9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hrct1Q9D6B9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hrct1Q9D6B9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hrct1Q9D6B9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hrct1Q9D6B9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hrct1Q9D6B9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hrct1Q9D6B9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hrct1Q9D6B9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hrct1Q9D6B9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hrct1Q9D6B9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hrct1Q9D6B9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hrct1Q9D6B9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hrct1Q9D6B9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hrct1Q9D6B9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hrct1Q9D6B9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hrct1Q9D6B9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hrct1Q9D6B9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hrct1Q9D6B9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hrct1Q9D6B9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hrct1Q9D6B9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hrct1Q9D6B9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hrct1Q9D6B9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hrct1Q9D6B9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hrct1Q9D6B9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hrct1Q9D6B9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hrct1Q9D6B9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hrct1Q9D6B9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hrct1Q9D6B9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hrct1Q9D6B9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hrct1Q9D6B9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hrct1Q9D6B9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hrct1Q9D6B9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hrct1Q9D6B9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hrct1Q9D6B9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hrct1Q9D6B9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hrct1Q9D6B9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hrct1Q9D6B9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hrct1Q9D6B9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hrct1Q9D6B9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hrct1Q9D6B9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hrct1Q9D6B9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hrct1Q9D6B9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hrct1Q9D6B9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hrct1Q9D6B9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hrct1Q9D6B9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hrct1Q9D6B9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hrct1Q9D6B9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hrct1Q9D6B9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hrct1Q9D6B9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hrct1Q9D6B9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hrct1Q9D6B9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hrct1Q9D6B9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hrct1Q9D6B9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hrct1Q9D6B9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hrct1Q9D6B9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hrct1Q9D6B9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hrct1Q9D6B9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hrct1Q9D6B9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hrct1Q9D6B9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hrct1Q9D6B9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hrct1Q9D6B9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hrct1Q9D6B9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hrct1Q9D6B9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hrct1Q9D6B9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hrct1Q9D6B9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hrct1Q9D6B9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hrct1Q9D6B9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hrct1Q9D6B9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hrct1Q9D6B9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hrct1Q9D6B9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hrct1Q9D6B9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hrct1Q9D6B9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hrct1Q9D6B9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hrct1Q9D6B9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hrct1Q9D6B9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms