Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rab11fip1Q9D620 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Rab11fip1Q9D620 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rab11fip1Q9D620 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rab11fip1Q9D620 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rab11fip1Q9D620 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rab11fip1Q9D620 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rab11fip1Q9D620 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rab11fip1Q9D620 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rab11fip1Q9D620 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rab11fip1Q9D620 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rab11fip1Q9D620 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rab11fip1Q9D620 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rab11fip1Q9D620 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rab11fip1Q9D620 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rab11fip1Q9D620 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rab11fip1Q9D620 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rab11fip1Q9D620 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rab11fip1Q9D620 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rab11fip1Q9D620 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rab11fip1Q9D620 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rab11fip1Q9D620 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Rab11fip1Q9D620 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rab11fip1Q9D620 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rab11fip1Q9D620 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rab11fip1Q9D620 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rab11fip1Q9D620 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rab11fip1Q9D620 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rab11fip1Q9D620 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rab11fip1Q9D620 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rab11fip1Q9D620 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rab11fip1Q9D620 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rab11fip1Q9D620 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rab11fip1Q9D620 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rab11fip1Q9D620 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rab11fip1Q9D620 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rab11fip1Q9D620 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Rab11fip1Q9D620 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rab11fip1Q9D620 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rab11fip1Q9D620 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rab11fip1Q9D620 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rab11fip1Q9D620 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rab11fip1Q9D620 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rab11fip1Q9D620 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rab11fip1Q9D620 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rab11fip1Q9D620 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rab11fip1Q9D620 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rab11fip1Q9D620 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rab11fip1Q9D620 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rab11fip1Q9D620 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rab11fip1Q9D620 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Rab11fip1Q9D620 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rab11fip1Q9D620 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rab11fip1Q9D620 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rab11fip1Q9D620 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rab11fip1Q9D620 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rab11fip1Q9D620 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rab11fip1Q9D620 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rab11fip1Q9D620 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rab11fip1Q9D620 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rab11fip1Q9D620 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rab11fip1Q9D620 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rab11fip1Q9D620 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rab11fip1Q9D620 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rab11fip1Q9D620 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rab11fip1Q9D620 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rab11fip1Q9D620 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rab11fip1Q9D620 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rab11fip1Q9D620 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rab11fip1Q9D620 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rab11fip1Q9D620 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rab11fip1Q9D620 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rab11fip1Q9D620 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rab11fip1Q9D620 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rab11fip1Q9D620 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rab11fip1Q9D620 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rab11fip1Q9D620 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rab11fip1Q9D620 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rab11fip1Q9D620 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rab11fip1Q9D620 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rab11fip1Q9D620 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Rab11fip1Q9D620 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rab11fip1Q9D620 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rab11fip1Q9D620 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rab11fip1Q9D620 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rab11fip1Q9D620 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Rab11fip1Q9D620 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rab11fip1Q9D620 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rab11fip1Q9D620 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rab11fip1Q9D620 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rab11fip1Q9D620 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rab11fip1Q9D620 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rab11fip1Q9D620 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rab11fip1Q9D620 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rab11fip1Q9D620 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rab11fip1Q9D620 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rab11fip1Q9D620 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rab11fip1Q9D620 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rab11fip1Q9D620 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rab11fip1Q9D620 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
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