Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4D5

4933414I15Rik, RIKEN cDNA 4933414I15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933414I15RikQ9D4D5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4933414I15RikQ9D4D5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
4933414I15RikQ9D4D5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
4933414I15RikQ9D4D5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4933414I15RikQ9D4D5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4933414I15RikQ9D4D5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4933414I15RikQ9D4D5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4933414I15RikQ9D4D5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4933414I15RikQ9D4D5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4933414I15RikQ9D4D5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4933414I15RikQ9D4D5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
4933414I15RikQ9D4D5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
4933414I15RikQ9D4D5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4933414I15RikQ9D4D5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4933414I15RikQ9D4D5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4933414I15RikQ9D4D5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4933414I15RikQ9D4D5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4933414I15RikQ9D4D5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4933414I15RikQ9D4D5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
4933414I15RikQ9D4D5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
4933414I15RikQ9D4D5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4933414I15RikQ9D4D5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4933414I15RikQ9D4D5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
4933414I15RikQ9D4D5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4933414I15RikQ9D4D5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
4933414I15RikQ9D4D5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
4933414I15RikQ9D4D5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4933414I15RikQ9D4D5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
4933414I15RikQ9D4D5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
4933414I15RikQ9D4D5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4933414I15RikQ9D4D5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
4933414I15RikQ9D4D5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
4933414I15RikQ9D4D5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4933414I15RikQ9D4D5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4933414I15RikQ9D4D5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4933414I15RikQ9D4D5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4933414I15RikQ9D4D5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
4933414I15RikQ9D4D5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
4933414I15RikQ9D4D5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4933414I15RikQ9D4D5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
4933414I15RikQ9D4D5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4933414I15RikQ9D4D5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
4933414I15RikQ9D4D5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
4933414I15RikQ9D4D5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4933414I15RikQ9D4D5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4933414I15RikQ9D4D5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
4933414I15RikQ9D4D5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
4933414I15RikQ9D4D5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4933414I15RikQ9D4D5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4933414I15RikQ9D4D5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4933414I15RikQ9D4D5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4933414I15RikQ9D4D5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4933414I15RikQ9D4D5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
4933414I15RikQ9D4D5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4933414I15RikQ9D4D5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
4933414I15RikQ9D4D5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
4933414I15RikQ9D4D5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
4933414I15RikQ9D4D5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4933414I15RikQ9D4D5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
4933414I15RikQ9D4D5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
4933414I15RikQ9D4D5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4933414I15RikQ9D4D5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
4933414I15RikQ9D4D5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4933414I15RikQ9D4D5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
4933414I15RikQ9D4D5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4933414I15RikQ9D4D5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
4933414I15RikQ9D4D5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933414I15RikQ9D4D5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933414I15RikQ9D4D5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933414I15RikQ9D4D5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.9 ms