Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1C1

Ube2c, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 C, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2cQ9D1C1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ube2cQ9D1C1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ube2cQ9D1C1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2cQ9D1C1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2cQ9D1C1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2cQ9D1C1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2cQ9D1C1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2cQ9D1C1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2cQ9D1C1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2cQ9D1C1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2cQ9D1C1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2cQ9D1C1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2cQ9D1C1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2cQ9D1C1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2cQ9D1C1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2cQ9D1C1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2cQ9D1C1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2cQ9D1C1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ube2cQ9D1C1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ube2cQ9D1C1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ube2cQ9D1C1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ube2cQ9D1C1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ube2cQ9D1C1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ube2cQ9D1C1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ube2cQ9D1C1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ube2cQ9D1C1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube2cQ9D1C1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube2cQ9D1C1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube2cQ9D1C1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube2cQ9D1C1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube2cQ9D1C1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube2cQ9D1C1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube2cQ9D1C1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube2cQ9D1C1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2cQ9D1C1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2cQ9D1C1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2cQ9D1C1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2cQ9D1C1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2cQ9D1C1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2cQ9D1C1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2cQ9D1C1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2cQ9D1C1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2cQ9D1C1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2cQ9D1C1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2cQ9D1C1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2cQ9D1C1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2cQ9D1C1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2cQ9D1C1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2cQ9D1C1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2cQ9D1C1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ube2cQ9D1C1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2cQ9D1C1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2cQ9D1C1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2cQ9D1C1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2cQ9D1C1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2cQ9D1C1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2cQ9D1C1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2cQ9D1C1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2cQ9D1C1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2cQ9D1C1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2cQ9D1C1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2cQ9D1C1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2cQ9D1C1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2cQ9D1C1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2cQ9D1C1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2cQ9D1C1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2cQ9D1C1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2cQ9D1C1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2cQ9D1C1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2cQ9D1C1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2cQ9D1C1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2cQ9D1C1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2cQ9D1C1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2cQ9D1C1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2cQ9D1C1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2cQ9D1C1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2cQ9D1C1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2cQ9D1C1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Ube2cQ9D1C1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2cQ9D1C1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2cQ9D1C1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2cQ9D1C1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2cQ9D1C1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2cQ9D1C1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2cQ9D1C1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2cQ9D1C1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2cQ9D1C1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2cQ9D1C1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ube2cQ9D1C1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube2cQ9D1C1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube2cQ9D1C1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube2cQ9D1C1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube2cQ9D1C1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube2cQ9D1C1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube2cQ9D1C1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube2cQ9D1C1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2cQ9D1C1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2cQ9D1C1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2cQ9D1C1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms