Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZR4

Cmtm8, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm8Q9CZR4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cmtm8Q9CZR4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cmtm8Q9CZR4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cmtm8Q9CZR4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cmtm8Q9CZR4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cmtm8Q9CZR4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cmtm8Q9CZR4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cmtm8Q9CZR4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cmtm8Q9CZR4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cmtm8Q9CZR4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cmtm8Q9CZR4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cmtm8Q9CZR4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cmtm8Q9CZR4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cmtm8Q9CZR4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cmtm8Q9CZR4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cmtm8Q9CZR4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cmtm8Q9CZR4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cmtm8Q9CZR4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cmtm8Q9CZR4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cmtm8Q9CZR4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cmtm8Q9CZR4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cmtm8Q9CZR4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cmtm8Q9CZR4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cmtm8Q9CZR4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cmtm8Q9CZR4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cmtm8Q9CZR4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cmtm8Q9CZR4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cmtm8Q9CZR4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cmtm8Q9CZR4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cmtm8Q9CZR4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cmtm8Q9CZR4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cmtm8Q9CZR4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cmtm8Q9CZR4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cmtm8Q9CZR4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cmtm8Q9CZR4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cmtm8Q9CZR4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cmtm8Q9CZR4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cmtm8Q9CZR4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cmtm8Q9CZR4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cmtm8Q9CZR4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cmtm8Q9CZR4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cmtm8Q9CZR4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cmtm8Q9CZR4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cmtm8Q9CZR4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cmtm8Q9CZR4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cmtm8Q9CZR4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cmtm8Q9CZR4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cmtm8Q9CZR4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cmtm8Q9CZR4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cmtm8Q9CZR4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cmtm8Q9CZR4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cmtm8Q9CZR4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cmtm8Q9CZR4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cmtm8Q9CZR4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cmtm8Q9CZR4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cmtm8Q9CZR4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cmtm8Q9CZR4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cmtm8Q9CZR4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cmtm8Q9CZR4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cmtm8Q9CZR4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cmtm8Q9CZR4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cmtm8Q9CZR4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cmtm8Q9CZR4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cmtm8Q9CZR4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cmtm8Q9CZR4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cmtm8Q9CZR4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cmtm8Q9CZR4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cmtm8Q9CZR4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cmtm8Q9CZR4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cmtm8Q9CZR4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cmtm8Q9CZR4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cmtm8Q9CZR4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cmtm8Q9CZR4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cmtm8Q9CZR4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cmtm8Q9CZR4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cmtm8Q9CZR4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cmtm8Q9CZR4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cmtm8Q9CZR4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cmtm8Q9CZR4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cmtm8Q9CZR4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cmtm8Q9CZR4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cmtm8Q9CZR4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cmtm8Q9CZR4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cmtm8Q9CZR4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cmtm8Q9CZR4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cmtm8Q9CZR4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cmtm8Q9CZR4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cmtm8Q9CZR4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cmtm8Q9CZR4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cmtm8Q9CZR4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cmtm8Q9CZR4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cmtm8Q9CZR4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cmtm8Q9CZR4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cmtm8Q9CZR4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cmtm8Q9CZR4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cmtm8Q9CZR4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cmtm8Q9CZR4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cmtm8Q9CZR4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cmtm8Q9CZR4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cmtm8Q9CZR4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms